中国科学C辑
中國科學C輯
중국과학C집
SCIENCE IN CHINA (SERIES C)
2007年
4期
427-434
,共8页
孔祥会%王绪祯%甘小妮%李俊兵%何舜平
孔祥會%王緒禎%甘小妮%李俊兵%何舜平
공상회%왕서정%감소니%리준병%하순평
鲤科(Cyprinidae)%S6K1基因%系统发育%内含子
鯉科(Cyprinidae)%S6K1基因%繫統髮育%內含子
리과(Cyprinidae)%S6K1기인%계통발육%내함자
鲤科鱼类在东亚分布广泛且数量丰富, 在物种演化上具有重要的系统发育地位. 本研究基于S6K1基因5′端功能调控序列, 通过PCR扩增、克隆和测序, 共获得30种鱼类S6K1 前端部分DNA序列(外显子1, 外显子2及内含子1), 对序列变异进行分析, 并采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)重建鲤科鱼类系统发育关系. 亚口鱼科的胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)作为外类群, 通过4种方法所得系统发育分支图大致相同, 均以较高的节点支持率支持雅罗鱼系和鲃系的划分, 雅罗鱼系包括雅罗鱼亚科东亚类群(East Asian group in Leuciscinae)、鲢亚科(Hypophthalmichthyinae)、鲴亚科(Xenocyprinae)、鲌亚科(Cultrinae)、亚科(Gobioninae)、鳑鲏亚科(Acheilognathinae)和亚科(Danioninae)部分种类; 系统分支图也以较高的节点支持率支持鲤科鱼类东亚类群形成单系群. 鲃系包括裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)、鲃亚科(Barbinae)、鲤亚科(Cyprininae)和野鲮亚科(Labeoninae); 另外, 亚科中的斑马鱼(Danio rerio), 麦氏(Danio myersi)和三线波鱼(Rasbora trilineata)形成一个单系群, 位于系统树基部. 以内含子1中大片段的插入或缺失(Indel)对物种分化及亲缘关系进行分析, 以帮助理解鲤科鱼类系统发育关系或争议物种之间的亲缘关系. 结果显示, 内含子1中大片段的插入或缺失与物种分化具有一定的相关性, 对于理解系统发育关系具有补充作用; 内含子1中有许多区域较为保守, 可能与功能调控有关, 但本研究中并未发现S6K1序列变异与鱼类物种特征尺寸之间具有对应关系.
鯉科魚類在東亞分佈廣汎且數量豐富, 在物種縯化上具有重要的繫統髮育地位. 本研究基于S6K1基因5′耑功能調控序列, 通過PCR擴增、剋隆和測序, 共穫得30種魚類S6K1 前耑部分DNA序列(外顯子1, 外顯子2及內含子1), 對序列變異進行分析, 併採用鄰接法(NJ)、最大簡約法(MP)、最大似然法(ML)和貝葉斯法(Bayesian)重建鯉科魚類繫統髮育關繫. 亞口魚科的胭脂魚(Myxocyprinus asiaticus)作為外類群, 通過4種方法所得繫統髮育分支圖大緻相同, 均以較高的節點支持率支持雅囉魚繫和鲃繫的劃分, 雅囉魚繫包括雅囉魚亞科東亞類群(East Asian group in Leuciscinae)、鰱亞科(Hypophthalmichthyinae)、鲴亞科(Xenocyprinae)、鲌亞科(Cultrinae)、亞科(Gobioninae)、鳑鲏亞科(Acheilognathinae)和亞科(Danioninae)部分種類; 繫統分支圖也以較高的節點支持率支持鯉科魚類東亞類群形成單繫群. 鲃繫包括裂腹魚亞科(Schizothoracinae)、鲃亞科(Barbinae)、鯉亞科(Cyprininae)和野鯪亞科(Labeoninae); 另外, 亞科中的斑馬魚(Danio rerio), 麥氏(Danio myersi)和三線波魚(Rasbora trilineata)形成一箇單繫群, 位于繫統樹基部. 以內含子1中大片段的插入或缺失(Indel)對物種分化及親緣關繫進行分析, 以幫助理解鯉科魚類繫統髮育關繫或爭議物種之間的親緣關繫. 結果顯示, 內含子1中大片段的插入或缺失與物種分化具有一定的相關性, 對于理解繫統髮育關繫具有補充作用; 內含子1中有許多區域較為保守, 可能與功能調控有關, 但本研究中併未髮現S6K1序列變異與魚類物種特徵呎吋之間具有對應關繫.
리과어류재동아분포엄범차수량봉부, 재물충연화상구유중요적계통발육지위. 본연구기우S6K1기인5′단공능조공서렬, 통과PCR확증、극륭화측서, 공획득30충어류S6K1 전단부분DNA서렬(외현자1, 외현자2급내함자1), 대서렬변이진행분석, 병채용린접법(NJ)、최대간약법(MP)、최대사연법(ML)화패협사법(Bayesian)중건리과어류계통발육관계. 아구어과적연지어(Myxocyprinus asiaticus)작위외류군, 통과4충방법소득계통발육분지도대치상동, 균이교고적절점지지솔지지아라어계화파계적화분, 아라어계포괄아라어아과동아류군(East Asian group in Leuciscinae)、련아과(Hypophthalmichthyinae)、고아과(Xenocyprinae)、백아과(Cultrinae)、아과(Gobioninae)、방피아과(Acheilognathinae)화아과(Danioninae)부분충류; 계통분지도야이교고적절점지지솔지지리과어류동아류군형성단계군. 파계포괄렬복어아과(Schizothoracinae)、파아과(Barbinae)、리아과(Cyprininae)화야릉아과(Labeoninae); 령외, 아과중적반마어(Danio rerio), 맥씨(Danio myersi)화삼선파어(Rasbora trilineata)형성일개단계군, 위우계통수기부. 이내함자1중대편단적삽입혹결실(Indel)대물충분화급친연관계진행분석, 이방조리해리과어류계통발육관계혹쟁의물충지간적친연관계. 결과현시, 내함자1중대편단적삽입혹결실여물충분화구유일정적상관성, 대우리해계통발육관계구유보충작용; 내함자1중유허다구역교위보수, 가능여공능조공유관, 단본연구중병미발현S6K1서렬변이여어류물충특정척촌지간구유대응관계.