野生动物
野生動物
야생동물
CHINESE WILDLIFE
2011年
3期
132-135
,共4页
张苗%柴洪亮%杨思远%侯志军%邢明伟%孙颖%华育平
張苗%柴洪亮%楊思遠%侯誌軍%邢明偉%孫穎%華育平
장묘%시홍량%양사원%후지군%형명위%손영%화육평
禽流感%HA分型%通用引物
禽流感%HA分型%通用引物
금류감%HA분형%통용인물
准确、方便快捷的禽流感病毒亚型鉴定方法对于野鸟流感病毒感染与流行状况的调查监测是十分必要的.本研究参照Phipps L P等人建立的通用引物RT-PCR HA亚型鉴定方法,分别对已知为H1,H2,H3,H4,H6和H11亚型的22株野鸟流感病毒毒株以及6株未知亚型的野鸟流感病毒毒株进行了HA亚型分型的验证性试验.即利用1对通用引物对所有病毒样品进行RT-PCR扩增,将各PCR产物进行核普酸序列测定并与GenBank上参考毒株序列进行同源性比较,以确定其HA亚型.BLAST分析显示,22株已知亚型毒株的PCR扩增产物的序列测定结果与GenBank公布的相应亚型毒株序列比较其核昔酸序列同源性均在99%-87%之间,而6株未知亚型的野鸟流感病毒毒株测得的核普酸序列经BLAST比对分别确立为1株H4,1株H5,2株H7,2株H11亚型.利用该通用引物HA亚型鉴定方法对于已知亚型所获得的鉴定结果均与实验室原亚型鉴定结果一致,对于未知亚型能准确的确定其HA的亚型.因此相较于其他HA亚型鉴定方法,该方法简便易行,更适合于野鸟流感病毒的亚型鉴定.
準確、方便快捷的禽流感病毒亞型鑒定方法對于野鳥流感病毒感染與流行狀況的調查鑑測是十分必要的.本研究參照Phipps L P等人建立的通用引物RT-PCR HA亞型鑒定方法,分彆對已知為H1,H2,H3,H4,H6和H11亞型的22株野鳥流感病毒毒株以及6株未知亞型的野鳥流感病毒毒株進行瞭HA亞型分型的驗證性試驗.即利用1對通用引物對所有病毒樣品進行RT-PCR擴增,將各PCR產物進行覈普痠序列測定併與GenBank上參攷毒株序列進行同源性比較,以確定其HA亞型.BLAST分析顯示,22株已知亞型毒株的PCR擴增產物的序列測定結果與GenBank公佈的相應亞型毒株序列比較其覈昔痠序列同源性均在99%-87%之間,而6株未知亞型的野鳥流感病毒毒株測得的覈普痠序列經BLAST比對分彆確立為1株H4,1株H5,2株H7,2株H11亞型.利用該通用引物HA亞型鑒定方法對于已知亞型所穫得的鑒定結果均與實驗室原亞型鑒定結果一緻,對于未知亞型能準確的確定其HA的亞型.因此相較于其他HA亞型鑒定方法,該方法簡便易行,更適閤于野鳥流感病毒的亞型鑒定.
준학、방편쾌첩적금류감병독아형감정방법대우야조류감병독감염여류행상황적조사감측시십분필요적.본연구삼조Phipps L P등인건립적통용인물RT-PCR HA아형감정방법,분별대이지위H1,H2,H3,H4,H6화H11아형적22주야조류감병독독주이급6주미지아형적야조류감병독독주진행료HA아형분형적험증성시험.즉이용1대통용인물대소유병독양품진행RT-PCR확증,장각PCR산물진행핵보산서렬측정병여GenBank상삼고독주서렬진행동원성비교,이학정기HA아형.BLAST분석현시,22주이지아형독주적PCR확증산물적서렬측정결과여GenBank공포적상응아형독주서렬비교기핵석산서렬동원성균재99%-87%지간,이6주미지아형적야조류감병독독주측득적핵보산서렬경BLAST비대분별학립위1주H4,1주H5,2주H7,2주H11아형.이용해통용인물HA아형감정방법대우이지아형소획득적감정결과균여실험실원아형감정결과일치,대우미지아형능준학적학정기HA적아형.인차상교우기타HA아형감정방법,해방법간편역행,경괄합우야조류감병독적아형감정.
