生物物理学报
生物物理學報
생물물이학보
ACTA BIOPHYSICA SINICA
2003年
1期
35-40
,共6页
王维宴%卢本卓%陈慰祖%王存新
王維宴%盧本卓%陳慰祖%王存新
왕유연%로본탁%진위조%왕존신
胰岛素六聚体%分子动力学模拟%构象柔性
胰島素六聚體%分子動力學模擬%構象柔性
이도소륙취체%분자동역학모의%구상유성
用分子动力学(MD)模拟方法设计了两个模拟时间为600ps的对比计算机模拟实验,研究了R6态的胰岛素六聚体在水溶液中的构象柔性.通过对MD模拟所得到的轨迹的分析发现,包含锌离子和苯酚的胰岛素六聚体体系的构象柔性弱于不含锌离子和苯酚的胰岛素六聚体体系,对于不包含锌离子和苯酚的体系,胰岛素六聚体的构象柔性表现得较为突出,特别是在实验研究认为与胰岛素和受体结合位点有关的每个单体的B链羧端的β折叠部分,发生了快速而显著的构象变化,表现出了很大的构象柔性.这些模拟结果与实验观测结果相吻合.
用分子動力學(MD)模擬方法設計瞭兩箇模擬時間為600ps的對比計算機模擬實驗,研究瞭R6態的胰島素六聚體在水溶液中的構象柔性.通過對MD模擬所得到的軌跡的分析髮現,包含鋅離子和苯酚的胰島素六聚體體繫的構象柔性弱于不含鋅離子和苯酚的胰島素六聚體體繫,對于不包含鋅離子和苯酚的體繫,胰島素六聚體的構象柔性錶現得較為突齣,特彆是在實驗研究認為與胰島素和受體結閤位點有關的每箇單體的B鏈羧耑的β摺疊部分,髮生瞭快速而顯著的構象變化,錶現齣瞭很大的構象柔性.這些模擬結果與實驗觀測結果相吻閤.
용분자동역학(MD)모의방법설계료량개모의시간위600ps적대비계산궤모의실험,연구료R6태적이도소륙취체재수용액중적구상유성.통과대MD모의소득도적궤적적분석발현,포함자리자화분분적이도소륙취체체계적구상유성약우불함자리자화분분적이도소륙취체체계,대우불포함자리자화분분적체계,이도소륙취체적구상유성표현득교위돌출,특별시재실험연구인위여이도소화수체결합위점유관적매개단체적B련최단적β절첩부분,발생료쾌속이현저적구상변화,표현출료흔대적구상유성.저사모의결과여실험관측결과상문합.