农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2011年
5期
864-872
,共9页
郝娟%罗军%王紫骞%赵旺生%孙雨婷%钟瑜%李君
郝娟%囉軍%王紫鶱%趙旺生%孫雨婷%鐘瑜%李君
학연%라군%왕자건%조왕생%손우정%종유%리군
西农萨能羊%47 kD尾部相互作用蛋白(TIP47)%脂滴形成%基因克隆%序列结构分析%组织表达
西農薩能羊%47 kD尾部相互作用蛋白(TIP47)%脂滴形成%基因剋隆%序列結構分析%組織錶達
서농살능양%47 kD미부상호작용단백(TIP47)%지적형성%기인극륭%서렬결구분석%조직표체
47 kD尾部相互作用蛋白基因(tail-interacting protein 47,TIP47)是影响脂滴形成和代谢的重要基因.本实验以两农萨能羊(Capra hircus)的乳腺组织为研究材料,采用RT-PCR和RACE,克隆了山羊TIP47基因的cDNA全长序列.结果得到TIP47基因cDNA序列全长1 906 bp(GenBank收录号为:HQ846827),包括5'UTR 82 bp,完整编码区1 314 bp及3'UTR 510 bp,编码蛋白质的氨基酸数为437,分子量47.36 kD,等电点(pI) 5.14.对TIP47基因的核苷酸和氨基酸序列分析发现,山羊的TIP47与GenBank中牛(Bos taurus)、人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)和猪(Sus scrofa)的TIP47相似性较高.蛋白质结构分析显示,TIP47不存在信号肽序列和跨膜结构;疏水性分析发现,其N端疏水性较强,中间靠近C端部分亲水性较强;三级结构分析发现,其C端呈大写的L形;该基因的遗传距离分析发现,山羊与牛的亲缘关系最近,其次是猪和人.通过RT-qPCR技术对TIP47基因进行了组织表达分析,发现所检测的12个组织中均有TIP47 mRNA的表达,其中乳腺组织中表达最丰富,且远远高于其它组织,脾脏、肺脏次之,肌肉相对最少.研究结果提示,TIP47基因可能在乳腺组织中对脂滴的形成代谢过程有重要作用.
47 kD尾部相互作用蛋白基因(tail-interacting protein 47,TIP47)是影響脂滴形成和代謝的重要基因.本實驗以兩農薩能羊(Capra hircus)的乳腺組織為研究材料,採用RT-PCR和RACE,剋隆瞭山羊TIP47基因的cDNA全長序列.結果得到TIP47基因cDNA序列全長1 906 bp(GenBank收錄號為:HQ846827),包括5'UTR 82 bp,完整編碼區1 314 bp及3'UTR 510 bp,編碼蛋白質的氨基痠數為437,分子量47.36 kD,等電點(pI) 5.14.對TIP47基因的覈苷痠和氨基痠序列分析髮現,山羊的TIP47與GenBank中牛(Bos taurus)、人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)和豬(Sus scrofa)的TIP47相似性較高.蛋白質結構分析顯示,TIP47不存在信號肽序列和跨膜結構;疏水性分析髮現,其N耑疏水性較彊,中間靠近C耑部分親水性較彊;三級結構分析髮現,其C耑呈大寫的L形;該基因的遺傳距離分析髮現,山羊與牛的親緣關繫最近,其次是豬和人.通過RT-qPCR技術對TIP47基因進行瞭組織錶達分析,髮現所檢測的12箇組織中均有TIP47 mRNA的錶達,其中乳腺組織中錶達最豐富,且遠遠高于其它組織,脾髒、肺髒次之,肌肉相對最少.研究結果提示,TIP47基因可能在乳腺組織中對脂滴的形成代謝過程有重要作用.
47 kD미부상호작용단백기인(tail-interacting protein 47,TIP47)시영향지적형성화대사적중요기인.본실험이량농살능양(Capra hircus)적유선조직위연구재료,채용RT-PCR화RACE,극륭료산양TIP47기인적cDNA전장서렬.결과득도TIP47기인cDNA서렬전장1 906 bp(GenBank수록호위:HQ846827),포괄5'UTR 82 bp,완정편마구1 314 bp급3'UTR 510 bp,편마단백질적안기산수위437,분자량47.36 kD,등전점(pI) 5.14.대TIP47기인적핵감산화안기산서렬분석발현,산양적TIP47여GenBank중우(Bos taurus)、인(Homo sapiens)、소서(Mus musculus)화저(Sus scrofa)적TIP47상사성교고.단백질결구분석현시,TIP47불존재신호태서렬화과막결구;소수성분석발현,기N단소수성교강,중간고근C단부분친수성교강;삼급결구분석발현,기C단정대사적L형;해기인적유전거리분석발현,산양여우적친연관계최근,기차시저화인.통과RT-qPCR기술대TIP47기인진행료조직표체분석,발현소검측적12개조직중균유TIP47 mRNA적표체,기중유선조직중표체최봉부,차원원고우기타조직,비장、폐장차지,기육상대최소.연구결과제시,TIP47기인가능재유선조직중대지적적형성대사과정유중요작용.