海洋科学进展
海洋科學進展
해양과학진전
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY OF HUANGHAI & BOHAI SEAS
2012年
1期
111-118
,共8页
苗婷婷%邢翔%杜宗军%陈冠军
苗婷婷%邢翔%杜宗軍%陳冠軍
묘정정%형상%두종군%진관군
柄海鞘%共附生细菌%16S rRNA基因%系统发育分析%细菌多样性
柄海鞘%共附生細菌%16S rRNA基因%繫統髮育分析%細菌多樣性
병해초%공부생세균%16S rRNA기인%계통발육분석%세균다양성
通过纯培养和16S rRNA基因序列的相似性比对,并构建系统发育树对威海海域柄海鞘共附生细菌的多样性进行了研究.用2216E培养基从柄海鞘样品中分离到78株细菌,通过形态学特征和TCBS培养基选择性筛选后,选取30株具有代表性的菌株进行了16S rRNA基因测序和基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析.结果表明,30株菌株分别属于细菌域的4个系统发育类群(Actinobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Groteobacteria)的11个科,11个属.根据16S rRNA基因序列,大多数菌株与其系统发育关系最密切的模式菌株之间存在一定的遗传差异(16S rRNA基因序列相似性为91.82%~98.93%).其中菌株HQW7,HQYD1,HQWD4,HQE1和HQE2与相关模式菌株的16S rRNA基因最高相似度仅分别为91.82%,92.51%,92.99%,93.52%,93.87%,这5株菌可能代表新的分类单元.威海海域柄海鞘共附生细菌存在着较为丰富的物种多样性和系统发育多样性,并可能存在新的物种.
通過純培養和16S rRNA基因序列的相似性比對,併構建繫統髮育樹對威海海域柄海鞘共附生細菌的多樣性進行瞭研究.用2216E培養基從柄海鞘樣品中分離到78株細菌,通過形態學特徵和TCBS培養基選擇性篩選後,選取30株具有代錶性的菌株進行瞭16S rRNA基因測序和基于16S rRNA基因序列的繫統髮育多樣性分析.結果錶明,30株菌株分彆屬于細菌域的4箇繫統髮育類群(Actinobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Groteobacteria)的11箇科,11箇屬.根據16S rRNA基因序列,大多數菌株與其繫統髮育關繫最密切的模式菌株之間存在一定的遺傳差異(16S rRNA基因序列相似性為91.82%~98.93%).其中菌株HQW7,HQYD1,HQWD4,HQE1和HQE2與相關模式菌株的16S rRNA基因最高相似度僅分彆為91.82%,92.51%,92.99%,93.52%,93.87%,這5株菌可能代錶新的分類單元.威海海域柄海鞘共附生細菌存在著較為豐富的物種多樣性和繫統髮育多樣性,併可能存在新的物種.
통과순배양화16S rRNA기인서렬적상사성비대,병구건계통발육수대위해해역병해초공부생세균적다양성진행료연구.용2216E배양기종병해초양품중분리도78주세균,통과형태학특정화TCBS배양기선택성사선후,선취30주구유대표성적균주진행료16S rRNA기인측서화기우16S rRNA기인서렬적계통발육다양성분석.결과표명,30주균주분별속우세균역적4개계통발육류군(Actinobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Groteobacteria)적11개과,11개속.근거16S rRNA기인서렬,대다수균주여기계통발육관계최밀절적모식균주지간존재일정적유전차이(16S rRNA기인서렬상사성위91.82%~98.93%).기중균주HQW7,HQYD1,HQWD4,HQE1화HQE2여상관모식균주적16S rRNA기인최고상사도부분별위91.82%,92.51%,92.99%,93.52%,93.87%,저5주균가능대표신적분류단원.위해해역병해초공부생세균존재착교위봉부적물충다양성화계통발육다양성,병가능존재신적물충.