水产学报
水產學報
수산학보
JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA
2003年
3期
213-218
,共6页
徐鹏%周令华%田丽萍%相建海
徐鵬%週令華%田麗萍%相建海
서붕%주령화%전려평%상건해
中国对虾%表达序列标签%微卫星
中國對蝦%錶達序列標籤%微衛星
중국대하%표체서렬표첨%미위성
利用生物信息学方法在含有10446个中国对虾ESTs的数据库中进行微卫星序列的筛选,共发现微卫星序列229个,占整个ESTs数据库的2.19%,其中含双碱基重复序列146个和3碱基重复序列58个,分别占在ESTs数据库中发现微卫星序列总数的63.76%和25.33%,大部分发现的微卫星序列均为Perfect形式的重复序列.根据筛选得到的微卫星序列设计并合成引物19对进行多态性检测,在有扩增产物的16对引物中,首次筛选得到8个中国对虾微卫星标记,并对这些微卫星标记进行了等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度、PIC值等统计学指标的评价.结果表明,在8个微卫星位点上,等位基因的数目从5到15不等,等位基因长度从165～305bp,期望杂合度和多态性信息含量分别为0.59到0.89和0.56到0.88,表明这8个中国对虾微卫星标记完全适合于遗传分析.
利用生物信息學方法在含有10446箇中國對蝦ESTs的數據庫中進行微衛星序列的篩選,共髮現微衛星序列229箇,佔整箇ESTs數據庫的2.19%,其中含雙堿基重複序列146箇和3堿基重複序列58箇,分彆佔在ESTs數據庫中髮現微衛星序列總數的63.76%和25.33%,大部分髮現的微衛星序列均為Perfect形式的重複序列.根據篩選得到的微衛星序列設計併閤成引物19對進行多態性檢測,在有擴增產物的16對引物中,首次篩選得到8箇中國對蝦微衛星標記,併對這些微衛星標記進行瞭等位基因頻率、觀測雜閤度、期望雜閤度、PIC值等統計學指標的評價.結果錶明,在8箇微衛星位點上,等位基因的數目從5到15不等,等位基因長度從165～305bp,期望雜閤度和多態性信息含量分彆為0.59到0.89和0.56到0.88,錶明這8箇中國對蝦微衛星標記完全適閤于遺傳分析.
이용생물신식학방법재함유10446개중국대하ESTs적수거고중진행미위성서렬적사선,공발현미위성서렬229개,점정개ESTs수거고적2.19%,기중함쌍감기중복서렬146개화3감기중복서렬58개,분별점재ESTs수거고중발현미위성서렬총수적63.76%화25.33%,대부분발현적미위성서렬균위Perfect형식적중복서렬.근거사선득도적미위성서렬설계병합성인물19대진행다태성검측,재유확증산물적16대인물중,수차사선득도8개중국대하미위성표기,병대저사미위성표기진행료등위기인빈솔、관측잡합도、기망잡합도、PIC치등통계학지표적평개.결과표명,재8개미위성위점상,등위기인적수목종5도15불등,등위기인장도종165～305bp,기망잡합도화다태성신식함량분별위0.59도0.89화0.56도0.88,표명저8개중국대하미위성표기완전괄합우유전분석.
