微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2007年
1期
150-155
,共6页
华绍烽%李树本%谭海东%赵家政
華紹烽%李樹本%譚海東%趙傢政
화소봉%리수본%담해동%조가정
甲烷单加氧酶%甲烷氧化细菌%序列分析%16S rDNA%进化分析
甲烷單加氧酶%甲烷氧化細菌%序列分析%16S rDNA%進化分析
갑완단가양매%갑완양화세균%서렬분석%16S rDNA%진화분석
甲烷氧化细菌中的关键酶系甲烷单加氧酶是一个含双核铁的多组份氧化酶,常温、常压下能够催化甲烷转化为甲醇.对甲烷氧化细菌Methylomonas sp.GYJ3中溶解性甲烷单加氧酶基因和16S rDNA进行了测序与分析.利用已知相关基因数据库信息,设计了PCR引物和测序引物,获得了满意的测序结果.全长的溶解性甲烷单加氧酶基因为5690bp,部分16S rDNA的序列长度为1280bp.与已发表的甲烷氧化细菌中甲烷单加氧酶进行了比较,结果表明MMOX组份中氨基酸序列的同一性为78%到99%,基因序列的同一性为71%到97%,6个组份中orfY片段的同一性相对较低.MMOX氨基酸序列的多序列联配表明,MMOX序列具有高度保守性,特别是在双核铁中心区域.16S rDNA进化分析显示Methylomonas sp.GYJ3与γ蛋白细菌是相关联的,基于MMOX氨基酸序列的进化分析证明,与Methylomonas sp.GYJ3最近似的菌株是Ⅰ型甲烷氧化细菌Methylomonas sp.KSWⅢ.综合分析表明,菌株GYJ3属于Ⅰ型甲烷氧化细菌Methylomonas sp.属.这个结果为Ⅰ型甲烷氧化细菌也能表达溶解性甲烷单加氧酶提供了新的证据.羟基化酶的理论等电点是6.28,理论分子量为248874.41Da.
甲烷氧化細菌中的關鍵酶繫甲烷單加氧酶是一箇含雙覈鐵的多組份氧化酶,常溫、常壓下能夠催化甲烷轉化為甲醇.對甲烷氧化細菌Methylomonas sp.GYJ3中溶解性甲烷單加氧酶基因和16S rDNA進行瞭測序與分析.利用已知相關基因數據庫信息,設計瞭PCR引物和測序引物,穫得瞭滿意的測序結果.全長的溶解性甲烷單加氧酶基因為5690bp,部分16S rDNA的序列長度為1280bp.與已髮錶的甲烷氧化細菌中甲烷單加氧酶進行瞭比較,結果錶明MMOX組份中氨基痠序列的同一性為78%到99%,基因序列的同一性為71%到97%,6箇組份中orfY片段的同一性相對較低.MMOX氨基痠序列的多序列聯配錶明,MMOX序列具有高度保守性,特彆是在雙覈鐵中心區域.16S rDNA進化分析顯示Methylomonas sp.GYJ3與γ蛋白細菌是相關聯的,基于MMOX氨基痠序列的進化分析證明,與Methylomonas sp.GYJ3最近似的菌株是Ⅰ型甲烷氧化細菌Methylomonas sp.KSWⅢ.綜閤分析錶明,菌株GYJ3屬于Ⅰ型甲烷氧化細菌Methylomonas sp.屬.這箇結果為Ⅰ型甲烷氧化細菌也能錶達溶解性甲烷單加氧酶提供瞭新的證據.羥基化酶的理論等電點是6.28,理論分子量為248874.41Da.
갑완양화세균중적관건매계갑완단가양매시일개함쌍핵철적다조빈양화매,상온、상압하능구최화갑완전화위갑순.대갑완양화세균Methylomonas sp.GYJ3중용해성갑완단가양매기인화16S rDNA진행료측서여분석.이용이지상관기인수거고신식,설계료PCR인물화측서인물,획득료만의적측서결과.전장적용해성갑완단가양매기인위5690bp,부분16S rDNA적서렬장도위1280bp.여이발표적갑완양화세균중갑완단가양매진행료비교,결과표명MMOX조빈중안기산서렬적동일성위78%도99%,기인서렬적동일성위71%도97%,6개조빈중orfY편단적동일성상대교저.MMOX안기산서렬적다서렬련배표명,MMOX서렬구유고도보수성,특별시재쌍핵철중심구역.16S rDNA진화분석현시Methylomonas sp.GYJ3여γ단백세균시상관련적,기우MMOX안기산서렬적진화분석증명,여Methylomonas sp.GYJ3최근사적균주시Ⅰ형갑완양화세균Methylomonas sp.KSWⅢ.종합분석표명,균주GYJ3속우Ⅰ형갑완양화세균Methylomonas sp.속.저개결과위Ⅰ형갑완양화세균야능표체용해성갑완단가양매제공료신적증거.간기화매적이론등전점시6.28,이론분자량위248874.41Da.