山地农业生物学报
山地農業生物學報
산지농업생물학보
JOURNAL OF MOUNTAIN AGRICULTURE AND BIOLOGY
2012年
5期
412-419
,共8页
姚俊%段国军%陈官国%彭海生%鲁富有%杨永军%李华春
姚俊%段國軍%陳官國%彭海生%魯富有%楊永軍%李華春
요준%단국군%진관국%팽해생%로부유%양영군%리화춘
山羊痘病毒%TaqMan%实时荧光定量PCR
山羊痘病毒%TaqMan%實時熒光定量PCR
산양두병독%TaqMan%실시형광정량PCR
根据GenBank中山羊痘病毒(AY077835) gp063基因DNA序列,应用Beacon Designer7.0软件,设计合成1对引物和1条TaqMan探针,同时制备含有靶DNA序列的pEASY-T1重组质粒标准品.通过引物、探针浓度的筛选及反应条件的优化,建立了山羊痘病毒TaqMan法实时荧光定量PCR.该方法组内和组间重复试验变异系数均低于2%,最低浓度检测极限值为1 ×100 copies/μL,上机检测时间少于40 min.运用该方法对不同时期流行于云南局部的山羊痘临床组织病料进行定量检测,生成的标准曲线斜率(Slope)为-3.36,截距(Intercept)为41.08,相关系数(R2)为0.999 989,阳性对照及送捡样品抽提DNA中病毒含量依次为:P(TK)2.70×105 copies/μL,华坪(HP)毒株1.45×106 copies/μL,景谷(JG)毒株5.12×105 copies/μL,保山(BS)毒株2.96×105 copies/μL,宣威(XW)毒株1.86×105 copies/μL,永胜(YS)毒株1.36×103 copies/μL.结果表明:所建立方法具有灵敏、特异、安全、快速的特点,适合于山羊痘的早期检测.
根據GenBank中山羊痘病毒(AY077835) gp063基因DNA序列,應用Beacon Designer7.0軟件,設計閤成1對引物和1條TaqMan探針,同時製備含有靶DNA序列的pEASY-T1重組質粒標準品.通過引物、探針濃度的篩選及反應條件的優化,建立瞭山羊痘病毒TaqMan法實時熒光定量PCR.該方法組內和組間重複試驗變異繫數均低于2%,最低濃度檢測極限值為1 ×100 copies/μL,上機檢測時間少于40 min.運用該方法對不同時期流行于雲南跼部的山羊痘臨床組織病料進行定量檢測,生成的標準麯線斜率(Slope)為-3.36,截距(Intercept)為41.08,相關繫數(R2)為0.999 989,暘性對照及送撿樣品抽提DNA中病毒含量依次為:P(TK)2.70×105 copies/μL,華坪(HP)毒株1.45×106 copies/μL,景穀(JG)毒株5.12×105 copies/μL,保山(BS)毒株2.96×105 copies/μL,宣威(XW)毒株1.86×105 copies/μL,永勝(YS)毒株1.36×103 copies/μL.結果錶明:所建立方法具有靈敏、特異、安全、快速的特點,適閤于山羊痘的早期檢測.
근거GenBank중산양두병독(AY077835) gp063기인DNA서렬,응용Beacon Designer7.0연건,설계합성1대인물화1조TaqMan탐침,동시제비함유파DNA서렬적pEASY-T1중조질립표준품.통과인물、탐침농도적사선급반응조건적우화,건립료산양두병독TaqMan법실시형광정량PCR.해방법조내화조간중복시험변이계수균저우2%,최저농도검측겁한치위1 ×100 copies/μL,상궤검측시간소우40 min.운용해방법대불동시기류행우운남국부적산양두림상조직병료진행정량검측,생성적표준곡선사솔(Slope)위-3.36,절거(Intercept)위41.08,상관계수(R2)위0.999 989,양성대조급송검양품추제DNA중병독함량의차위:P(TK)2.70×105 copies/μL,화평(HP)독주1.45×106 copies/μL,경곡(JG)독주5.12×105 copies/μL,보산(BS)독주2.96×105 copies/μL,선위(XW)독주1.86×105 copies/μL,영성(YS)독주1.36×103 copies/μL.결과표명:소건립방법구유령민、특이、안전、쾌속적특점,괄합우산양두적조기검측.