高等学校化学学报
高等學校化學學報
고등학교화학학보
CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES
2007年
6期
1160-1164
,共5页
郝兰%张勇%谭宏伟%陈光巨
郝蘭%張勇%譚宏偉%陳光巨
학란%장용%담굉위%진광거
BBR3464([{trans-PtCl(NH3)2}2-μ-{trans-Pt(NH3)2(NH2(CH2)…6NH2)2}]4+)%DNA片段%分子力学方法%分子动力学方法%量子化学方法
BBR3464([{trans-PtCl(NH3)2}2-μ-{trans-Pt(NH3)2(NH2(CH2)…6NH2)2}]4+)%DNA片段%分子力學方法%分子動力學方法%量子化學方法
BBR3464([{trans-PtCl(NH3)2}2-μ-{trans-Pt(NH3)2(NH2(CH2)…6NH2)2}]4+)%DNA편단%분자역학방법%분자동역학방법%양자화학방법
利用分子力学、分子动力学和量子化学等计算方法研究了新型临床二期抗癌药物BBR3464([{trans-PtCl(NH3)2}2-μ-{trans-Pt(NH3)2(NH2(CH2)…6NH2)2}]4+)与寡聚DNA片段复合物的几何构型及其电子结构. 结果表明, 利用分子力学和分子动力学确定的复合物结构与实验的基本吻合. BBR3464为+4价高电荷铂药, 与两端的铂相连的两个Cl配体间的距离是2.74 nm, 这使得药物与DNA交联速度快, 形成远程的1,4-链间交联.计算结果表明, BBR3464与DNA识别能力强, 结合稳定. 所形成的复合物中既有Pt-N7间较强的配位键, 也存在许多氢键、弱氢键及静电作用. 复合物中结合位点及结合位点外的嘌呤碱基的构象发生了不同程度的改变. 复合物结构特征说明, DNA在键合药物后其构型并未发生定域的链弯曲, 而是离域的嘌呤碱基的构象转化, 其对DNA所造成离域性损伤与经典的药物不同. DNA是铂抗肿瘤药物的靶点, 多点键合和离域性损伤的结构特征与BBR3464的独特生物活性和临床表现相关.
利用分子力學、分子動力學和量子化學等計算方法研究瞭新型臨床二期抗癌藥物BBR3464([{trans-PtCl(NH3)2}2-μ-{trans-Pt(NH3)2(NH2(CH2)…6NH2)2}]4+)與寡聚DNA片段複閤物的幾何構型及其電子結構. 結果錶明, 利用分子力學和分子動力學確定的複閤物結構與實驗的基本吻閤. BBR3464為+4價高電荷鉑藥, 與兩耑的鉑相連的兩箇Cl配體間的距離是2.74 nm, 這使得藥物與DNA交聯速度快, 形成遠程的1,4-鏈間交聯.計算結果錶明, BBR3464與DNA識彆能力彊, 結閤穩定. 所形成的複閤物中既有Pt-N7間較彊的配位鍵, 也存在許多氫鍵、弱氫鍵及靜電作用. 複閤物中結閤位點及結閤位點外的嘌呤堿基的構象髮生瞭不同程度的改變. 複閤物結構特徵說明, DNA在鍵閤藥物後其構型併未髮生定域的鏈彎麯, 而是離域的嘌呤堿基的構象轉化, 其對DNA所造成離域性損傷與經典的藥物不同. DNA是鉑抗腫瘤藥物的靶點, 多點鍵閤和離域性損傷的結構特徵與BBR3464的獨特生物活性和臨床錶現相關.
이용분자역학、분자동역학화양자화학등계산방법연구료신형림상이기항암약물BBR3464([{trans-PtCl(NH3)2}2-μ-{trans-Pt(NH3)2(NH2(CH2)…6NH2)2}]4+)여과취DNA편단복합물적궤하구형급기전자결구. 결과표명, 이용분자역학화분자동역학학정적복합물결구여실험적기본문합. BBR3464위+4개고전하박약, 여량단적박상련적량개Cl배체간적거리시2.74 nm, 저사득약물여DNA교련속도쾌, 형성원정적1,4-련간교련.계산결과표명, BBR3464여DNA식별능력강, 결합은정. 소형성적복합물중기유Pt-N7간교강적배위건, 야존재허다경건、약경건급정전작용. 복합물중결합위점급결합위점외적표령감기적구상발생료불동정도적개변. 복합물결구특정설명, DNA재건합약물후기구형병미발생정역적련만곡, 이시리역적표령감기적구상전화, 기대DNA소조성리역성손상여경전적약물불동. DNA시박항종류약물적파점, 다점건합화리역성손상적결구특정여BBR3464적독특생물활성화림상표현상관.