食品与生物技术学报
食品與生物技術學報
식품여생물기술학보
JOURNAL OF FOOD SCIENCE AND BIOTECHNOLOGY
2008年
1期
71-75
,共5页
非线性预测方法%蛋白质序列%蛋白质分类
非線性預測方法%蛋白質序列%蛋白質分類
비선성예측방법%단백질서렬%단백질분류
通过详细HP模型将一条蛋白质序列构造为3个特征序列.其中蛋白质序列取自蛋白质分类数据库CATH,该库将蛋白质序列根据不同结构域分为4类(α主类,β主类,αβ类,低二级结构类).然后采用非线性预测方法,研究每类蛋白质序列的特征序列,得到特征序列的误差比值(E-D)图.从图形上发现,每类蛋白质序列的每条特征序列的曲线起伏波动不断,具有特异性,且4类蛋白质序列对应特征序列的E-D图之间也有很大不同.
通過詳細HP模型將一條蛋白質序列構造為3箇特徵序列.其中蛋白質序列取自蛋白質分類數據庫CATH,該庫將蛋白質序列根據不同結構域分為4類(α主類,β主類,αβ類,低二級結構類).然後採用非線性預測方法,研究每類蛋白質序列的特徵序列,得到特徵序列的誤差比值(E-D)圖.從圖形上髮現,每類蛋白質序列的每條特徵序列的麯線起伏波動不斷,具有特異性,且4類蛋白質序列對應特徵序列的E-D圖之間也有很大不同.
통과상세HP모형장일조단백질서렬구조위3개특정서렬.기중단백질서렬취자단백질분류수거고CATH,해고장단백질서렬근거불동결구역분위4류(α주류,β주류,αβ류,저이급결구류).연후채용비선성예측방법,연구매류단백질서렬적특정서렬,득도특정서렬적오차비치(E-D)도.종도형상발현,매류단백질서렬적매조특정서렬적곡선기복파동불단,구유특이성,차4류단백질서렬대응특정서렬적E-D도지간야유흔대불동.
