浙江农林大学学报
浙江農林大學學報
절강농림대학학보
JOURNAL OF ZHEJIANG FORESTRY COLLEGE
2012年
4期
574-580
,共7页
徐跃%宋敏国%杨仙玉%袁进强
徐躍%宋敏國%楊仙玉%袁進彊
서약%송민국%양선옥%원진강
动物学%中华大蟾蜍%galectin-3%分子多样性%生物适应
動物學%中華大蟾蜍%galectin-3%分子多樣性%生物適應
동물학%중화대섬서%galectin-3%분자다양성%생물괄응
以中华大蟾蜍Bzfo gargarizans皮肤总核糖核酸(RNA)反转录第1链互补脱氧核糖核酸(cDNA)为模板,以聚合酶链式反应(PCR)扩增出galec tin-3基因片段并通过TA克隆将其插入到pGM-T载体,通过DNA测序确定该基因片段序列,然后利用美国国家生物技术信息中心(NCBI)中ORF finder查找基因的全长开放阅读框(ORF).筛选到9个编码galectin-3的cDNA序列,其中2个序列编码N-端截短型galectin-3(galectin-3C).Clustal X2.0多序列比对和DnaSP4.0分析cDNA序列的多样性.结果发现:中华大蟾蜍alectin-3C区域具有高密度的单核苷酸多态性(SNP),频率为每20 bp为1个单核苷酸多态性.推导的氨基酸序列比对显示这9个基因在N端和糖识别结构域(CRD)有较高同源性,包括磷酸化位点、糖基结合位点和相关基序,而在串联重复区则存在较大差异.galectin-3基因及其编码蛋白的多样性很可能赋予中华大蟾蜍很强的环境适应能力.
以中華大蟾蜍Bzfo gargarizans皮膚總覈糖覈痠(RNA)反轉錄第1鏈互補脫氧覈糖覈痠(cDNA)為模闆,以聚閤酶鏈式反應(PCR)擴增齣galec tin-3基因片段併通過TA剋隆將其插入到pGM-T載體,通過DNA測序確定該基因片段序列,然後利用美國國傢生物技術信息中心(NCBI)中ORF finder查找基因的全長開放閱讀框(ORF).篩選到9箇編碼galectin-3的cDNA序列,其中2箇序列編碼N-耑截短型galectin-3(galectin-3C).Clustal X2.0多序列比對和DnaSP4.0分析cDNA序列的多樣性.結果髮現:中華大蟾蜍alectin-3C區域具有高密度的單覈苷痠多態性(SNP),頻率為每20 bp為1箇單覈苷痠多態性.推導的氨基痠序列比對顯示這9箇基因在N耑和糖識彆結構域(CRD)有較高同源性,包括燐痠化位點、糖基結閤位點和相關基序,而在串聯重複區則存在較大差異.galectin-3基因及其編碼蛋白的多樣性很可能賦予中華大蟾蜍很彊的環境適應能力.
이중화대섬서Bzfo gargarizans피부총핵당핵산(RNA)반전록제1련호보탈양핵당핵산(cDNA)위모판,이취합매련식반응(PCR)확증출galec tin-3기인편단병통과TA극륭장기삽입도pGM-T재체,통과DNA측서학정해기인편단서렬,연후이용미국국가생물기술신식중심(NCBI)중ORF finder사조기인적전장개방열독광(ORF).사선도9개편마galectin-3적cDNA서렬,기중2개서렬편마N-단절단형galectin-3(galectin-3C).Clustal X2.0다서렬비대화DnaSP4.0분석cDNA서렬적다양성.결과발현:중화대섬서alectin-3C구역구유고밀도적단핵감산다태성(SNP),빈솔위매20 bp위1개단핵감산다태성.추도적안기산서렬비대현시저9개기인재N단화당식별결구역(CRD)유교고동원성,포괄린산화위점、당기결합위점화상관기서,이재천련중복구칙존재교대차이.galectin-3기인급기편마단백적다양성흔가능부여중화대섬서흔강적배경괄응능력.
