CAJ | 학술논문

利用圆斑星鲽(Verasper variegatus Temminck et Schlegel)和相关鱼类的部分线粒体基因序列,设计出6对扩增引物,通过PCR扩增产物直接测序和引物行走(Primer walking)法测定圆斑星鲽线粒体基因组全序列,并对其进行结构与进化分析.圆斑星鲽线粒体基因组序列长17 273 bp,其基因序列及构成都与其他硬骨鱼基本相同,包括37个基因(2个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因)和2个非编码区(控制区和WANCY区).在22个tRNA基因中,tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNATyr、tRNASer(第2个)、tRNAGlu和tRNAPro的编码基因位于L链上,其余则位于H链上.在13个蛋白质编码基因中,除了COI基因的起始密码子为GTG外,其余均以ATG为起始密码子.蛋白质编码基因包括具有完整TAA终止密码子的ND1,COI,ATP8,ND4L,ND5,而其他蛋白编码基因则具有不完全终止密码子.在L链上,ND6是仅有的一个蛋白质编码基因.圆斑星蝶的控制区包含1个终止相关序列区(ETAS)、6个中央保守序列区(CSB-A、B、C、D、E、F)和3个保守序列区(CSB-1、2、3)以及长串联重复区(Tandernly repeat sequence).用NJ法和MP法对5个目22种鱼mtDNA的13个蛋白质编码基因的氨基酸序列进行系统分析,结果显示,圆斑星蝶与石鲽关系最近,鲽形目的鲆、鲽类与鲈形目的鲹科(Carangidae)、鲷科(Sparidae)鱼类亲缘关系较近,而同属于鲽形目的塞内加尔鳎(Solea senegalensis)没有和任何目聚在一起,成为一个独立的分支.圆斑星蝶的基因组全序列序列已提交到GenBank,登录号为DQ403797,控制区单元型序列的GenBank登录号为DQ834444～7.
이용원반성접(Verasper variegatus Temminck et Schlegel)화상관어류적부분선립체기인서렬,설계출6대확증인물,통과PCR확증산물직접측서화인물행주(Primer walking)법측정원반성접선립체기인조전서렬,병대기진행결구여진화분석.원반성접선립체기인조서렬장17 273 bp,기기인서렬급구성도여기타경골어기본상동,포괄37개기인(2개rRNA기인、22개tRNA기인화13개단백질편마기인)화2개비편마구(공제구화WANCY구).재22개tRNA기인중,tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNATyr、tRNASer(제2개)、tRNAGlu화tRNAPro적편마기인위우L련상,기여칙위우H련상.재13개단백질편마기인중,제료COI기인적기시밀마자위GTG외,기여균이ATG위기시밀마자.단백질편마기인포괄구유완정TAA종지밀마자적ND1,COI,ATP8,ND4L,ND5,이기타단백편마기인칙구유불완전종지밀마자.재L련상,ND6시부유적일개단백질편마기인.원반성접적공제구포함1개종지상관서렬구(ETAS)、6개중앙보수서렬구(CSB-A、B、C、D、E、F)화3개보수서렬구(CSB-1、2、3)이급장천련중복구(Tandernly repeat sequence).용NJ법화MP법대5개목22충어mtDNA적13개단백질편마기인적안기산서렬진행계통분석,결과현시,원반성접여석접관계최근,접형목적평、접류여로형목적소과(Carangidae)、조과(Sparidae)어류친연관계교근,이동속우접형목적새내가이탑(Solea senegalensis)몰유화임하목취재일기,성위일개독립적분지.원반성접적기인조전서렬서렬이제교도GenBank,등록호위DQ403797,공제구단원형서렬적GenBank등록호위DQ834444～7.