广西农学报
廣西農學報
엄서농학보
JOURNAL OF GUANGXI AGRICULTURE
2011年
5期
25-31
,共7页
花生%DOF%转录因子%种子发育%蛋白质结构
花生%DOF%轉錄因子%種子髮育%蛋白質結構
화생%DOF%전록인자%충자발육%단백질결구
Peanut%DOF%transcription factor%seed growth%protein structure
Dof(DNA binding with one finger)转录因子是一类植物特有的、进化上高度保守的基因家族,对植物多方面的生理过程均发挥调控作用。根据Dof家族中的一个B06基因的cDNA保守序列设计引物,对8个品种花生的B06基因进行PCR扩增克隆相似基因,并测定序列。实验成功克隆出四粒红和073103的完整1306基因和其余6个品种的大部分B06基因,其中073103含有一个内含子,其余7个品种不合内含子。通过比较8个品种间B06基因的序列差异与品种性状间的关系,并通过生物信息学对基因及编码蛋白进行分析,探究B06蛋白可能的功能。结果发现:典型的B06蛋白由176个氨基酸组成,在N-端附近37个氨基酸区域处形成保守的单锌指DOF结构;推测在DOF区域后的59—67氨基酸处有核定位信号序列;蛋白序列中有多个N-糖基化、蛋白激酶C磷酸化、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化、N-十四烷酰基化位点,可以接受不同途径的信号刺激,修饰前后发生定位或活性的变,推测1306蛋白可能与植物对外界刺激的反应相关。结合性状分析,推测1306蛋白与花生种子中的脂肪和蛋白质含量高低无明显联系。试验为进一步深入研究B06蛋白的功能奠定了基础。
Dof(DNA binding with one finger)轉錄因子是一類植物特有的、進化上高度保守的基因傢族,對植物多方麵的生理過程均髮揮調控作用。根據Dof傢族中的一箇B06基因的cDNA保守序列設計引物,對8箇品種花生的B06基因進行PCR擴增剋隆相似基因,併測定序列。實驗成功剋隆齣四粒紅和073103的完整1306基因和其餘6箇品種的大部分B06基因,其中073103含有一箇內含子,其餘7箇品種不閤內含子。通過比較8箇品種間B06基因的序列差異與品種性狀間的關繫,併通過生物信息學對基因及編碼蛋白進行分析,探究B06蛋白可能的功能。結果髮現:典型的B06蛋白由176箇氨基痠組成,在N-耑附近37箇氨基痠區域處形成保守的單鋅指DOF結構;推測在DOF區域後的59—67氨基痠處有覈定位信號序列;蛋白序列中有多箇N-糖基化、蛋白激酶C燐痠化、酪蛋白激酶Ⅱ燐痠化、N-十四烷酰基化位點,可以接受不同途徑的信號刺激,脩飾前後髮生定位或活性的變,推測1306蛋白可能與植物對外界刺激的反應相關。結閤性狀分析,推測1306蛋白與花生種子中的脂肪和蛋白質含量高低無明顯聯繫。試驗為進一步深入研究B06蛋白的功能奠定瞭基礎。
Dof(DNA binding with one finger)전록인자시일류식물특유적、진화상고도보수적기인가족,대식물다방면적생리과정균발휘조공작용。근거Dof가족중적일개B06기인적cDNA보수서렬설계인물,대8개품충화생적B06기인진행PCR확증극륭상사기인,병측정서렬。실험성공극륭출사립홍화073103적완정1306기인화기여6개품충적대부분B06기인,기중073103함유일개내함자,기여7개품충불합내함자。통과비교8개품충간B06기인적서렬차이여품충성상간적관계,병통과생물신식학대기인급편마단백진행분석,탐구B06단백가능적공능。결과발현:전형적B06단백유176개안기산조성,재N-단부근37개안기산구역처형성보수적단자지DOF결구;추측재DOF구역후적59—67안기산처유핵정위신호서렬;단백서렬중유다개N-당기화、단백격매C린산화、락단백격매Ⅱ린산화、N-십사완선기화위점,가이접수불동도경적신호자격,수식전후발생정위혹활성적변,추측1306단백가능여식물대외계자격적반응상관。결합성상분석,추측1306단백여화생충자중적지방화단백질함량고저무명현련계。시험위진일보심입연구B06단백적공능전정료기출。
Dof(DNA binding with one finger)transcription factors is a highly conserved gene family, which play a role of regulation and control in various physiological processes of plant. According to conserved sequences of 1306 gene eDNA, with a pair of primers, DOF 1306 similar genes were cloned, sequenced and compared from genomic DNA of eight cultivar. The results showed that a typical B06 protein is composed of 176 animo adds, in which a DOF domain close to N-terminal with 37 animo acids forming the typical single zinc finger structure; B06 protein does not contain a signal peptide at the N-terminal, and the domain next to DOF domain with 9 animo acids are predicted as a nuclear localization signal (NLS); there exit 3 N-glycosylation sites, 2 protein kinase C phosphorylation site, 1 casein kinase II phosphorylation site and 3 N-myristoylation sites acceptting signal stimulus via different ways, suggest that localization and activity of B06 alters before or after the modification; presumably related with the responds to the outside stimulus.