西部林业科学
西部林業科學
서부임업과학
JOURNAL OF WEST CHINA FORESTRY SCIENCE
2011年
4期
5-11
,共7页
彭桂莎%杨宇明%孙浩%张怀璧%王娟
彭桂莎%楊宇明%孫浩%張懷璧%王娟
팽계사%양우명%손호%장부벽%왕연
Myb基因%生物信息学分析%棉花竹%苯丙氨酸代谢
Myb基因%生物信息學分析%棉花竹%苯丙氨痠代謝
Myb기인%생물신식학분석%면화죽%분병안산대사
以项目组已克隆并在GenBank中登记的棉花竹的FsMyb1基因(GU390881)序列为基础,利用生物信息学分析方法,对其编码的FsMyb1蛋白进行理化性质、分子结构、生物功能预测和分析.结果显示,棉花竹FsMyb1基因编码是一种亲水性蛋白质;无信号肽,无导肽,无跨膜结构域;亚细胞定位为细胞核;共有2个糖基化位点和21个磷酸化位点.二级结构包括无规则卷曲、α-螺旋、延伸链;三级结构的构象为α - helix/loop混合型构象,是典型的R2R3 - Myb转录因子.同源比对和进化分析结果显示,FsMyb1蛋白与OsMyb等蛋白有很高的同源性.初步推测,FsMyb1蛋白可能是一类调节苯丙氨酸代谢,尤其是一种与调节次生细胞壁增厚和花青素生物合成功能相关的转录调节因子.
以項目組已剋隆併在GenBank中登記的棉花竹的FsMyb1基因(GU390881)序列為基礎,利用生物信息學分析方法,對其編碼的FsMyb1蛋白進行理化性質、分子結構、生物功能預測和分析.結果顯示,棉花竹FsMyb1基因編碼是一種親水性蛋白質;無信號肽,無導肽,無跨膜結構域;亞細胞定位為細胞覈;共有2箇糖基化位點和21箇燐痠化位點.二級結構包括無規則捲麯、α-螺鏇、延伸鏈;三級結構的構象為α - helix/loop混閤型構象,是典型的R2R3 - Myb轉錄因子.同源比對和進化分析結果顯示,FsMyb1蛋白與OsMyb等蛋白有很高的同源性.初步推測,FsMyb1蛋白可能是一類調節苯丙氨痠代謝,尤其是一種與調節次生細胞壁增厚和花青素生物閤成功能相關的轉錄調節因子.
이항목조이극륭병재GenBank중등기적면화죽적FsMyb1기인(GU390881)서렬위기출,이용생물신식학분석방법,대기편마적FsMyb1단백진행이화성질、분자결구、생물공능예측화분석.결과현시,면화죽FsMyb1기인편마시일충친수성단백질;무신호태,무도태,무과막결구역;아세포정위위세포핵;공유2개당기화위점화21개린산화위점.이급결구포괄무규칙권곡、α-라선、연신련;삼급결구적구상위α - helix/loop혼합형구상,시전형적R2R3 - Myb전록인자.동원비대화진화분석결과현시,FsMyb1단백여OsMyb등단백유흔고적동원성.초보추측,FsMyb1단백가능시일류조절분병안산대사,우기시일충여조절차생세포벽증후화화청소생물합성공능상관적전록조절인자.