应用预防医学
應用預防醫學
응용예방의학
JOURNAL OF APPLIED PREVENTIVE MEDICINE
2011年
5期
272-276
,共5页
闭福银%谢镇国%陈敏玫%周开娇%康宁%居昱%莫兆军%谭毅
閉福銀%謝鎮國%陳敏玫%週開嬌%康寧%居昱%莫兆軍%譚毅
폐복은%사진국%진민매%주개교%강저%거욱%막조군%담의
肠道病毒%EV71%全基因组%序列分析
腸道病毒%EV71%全基因組%序列分析
장도병독%EV71%전기인조%서렬분석
目的 了解肠道病毒71型CZ01株的全基因组分子特征.方法 应用覆盖病毒全基因组的15对特异性引物对毒株进行RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,拼接后得到全基因序列,应用Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1等生物软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析.结果 CZ01株病毒全基因组核苷酸序列长度为7 406bp,与中国大陆北京毒株BJ08-Z011-4和安徽阜阳毒株Fuyang.Anhui/17.08/2整个基因组核苷酸同源性为98.8％和98.5％,氨基酸同源性分别为99.7％和99.6％；与EV71国际标准株MS/7423/87和BrCr基因组核苷酸同源性仅为81.7％和80.0％,氨基酸同源性为95.6％和94.9％.对外壳蛋白VP1编码区进行种系发生分析显示CZ01株为C4亚型的毒株.结论 EV71型病毒CZ01株全基因组的组成和结构符合肠道病毒特征,与其它EV71型病毒具有相同的基因组结构,CZ01株是EV71型的C4亚型的毒株.
目的 瞭解腸道病毒71型CZ01株的全基因組分子特徵.方法 應用覆蓋病毒全基因組的15對特異性引物對毒株進行RT-PCR擴增,PCR產物直接測序,拼接後得到全基因序列,應用Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1等生物軟件進行覈苷痠序列及氨基痠序列分析和病毒的繫統進化分析.結果 CZ01株病毒全基因組覈苷痠序列長度為7 406bp,與中國大陸北京毒株BJ08-Z011-4和安徽阜暘毒株Fuyang.Anhui/17.08/2整箇基因組覈苷痠同源性為98.8％和98.5％,氨基痠同源性分彆為99.7％和99.6％；與EV71國際標準株MS/7423/87和BrCr基因組覈苷痠同源性僅為81.7％和80.0％,氨基痠同源性為95.6％和94.9％.對外殼蛋白VP1編碼區進行種繫髮生分析顯示CZ01株為C4亞型的毒株.結論 EV71型病毒CZ01株全基因組的組成和結構符閤腸道病毒特徵,與其它EV71型病毒具有相同的基因組結構,CZ01株是EV71型的C4亞型的毒株.
목적 료해장도병독71형CZ01주적전기인조분자특정.방법 응용복개병독전기인조적15대특이성인물대독주진행RT-PCR확증,PCR산물직접측서,병접후득도전기인서렬,응용Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1등생물연건진행핵감산서렬급안기산서렬분석화병독적계통진화분석.결과 CZ01주병독전기인조핵감산서렬장도위7 406bp,여중국대륙북경독주BJ08-Z011-4화안휘부양독주Fuyang.Anhui/17.08/2정개기인조핵감산동원성위98.8％화98.5％,안기산동원성분별위99.7％화99.6％；여EV71국제표준주MS/7423/87화BrCr기인조핵감산동원성부위81.7％화80.0％,안기산동원성위95.6％화94.9％.대외각단백VP1편마구진행충계발생분석현시CZ01주위C4아형적독주.결론 EV71형병독CZ01주전기인조적조성화결구부합장도병독특정,여기타EV71형병독구유상동적기인조결구,CZ01주시EV71형적C4아형적독주.
