CAJ | 학술논문

SBP(squamosa promoter binding protein,SBP)基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导.葡萄是继拟南芥、水稻和杨树之后完成全基因组测序的第四种开花植物,因此葡萄逐渐成为分子生物学研究的重点对象,进行葡萄基因组信息挖掘与分析对于葡萄功能基因组学的发展具有重要意义.本文利用生物信息学方法对葡萄家族45条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的SBP基因家族之间的联系.结果显示这45条蛋白序列与拟南芥16个SBP基因蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与葡萄SBP基因间具有较高的保守性;进一步的基因组定位结果发现其分布在14条染色体上,较拟南芥在染色体上的分布更为分散.研究还发现不同亚家族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;而二级结构预测结果发现,41条氨基酸序列以随机卷曲为主要组成部分,这与拟南芥相似,且45条氨基酸序列三维结构十分相似.本文实验结果均为葡萄SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础.
SBP(squamosa promoter binding protein,SBP)기인가족시식물소특유적일류중요전록인자,엄범삼여식물생장、발육이급다충생리생화반응적신호전도.포도시계의남개、수도화양수지후완성전기인조측서적제사충개화식물,인차포도축점성위분자생물학연구적중점대상,진행포도기인조신식알굴여분석대우포도공능기인조학적발전구유중요의의.본문이용생물신식학방법대포도가족45조SBP단백서렬적계통발생화SBP기인조정위진행분석,연후대기안기산조성성분、이화성질이급이급화삼급결구진행예측화분석,동시환분석료포도여의남개적SBP기인가족지간적련계.결과현시저45조단백서렬여의남개16개SBP기인단백서렬일기분성료3개아족,설명의남개여포도SBP기인간구유교고적보수성;진일보적기인조정위결과발현기분포재14조염색체상,교의남개재염색체상적분포경위분산.연구환발현불동아가족간안기산수목、안기산서렬간적소수성존재일정적차이;이이급결구예측결과발현,41조안기산서렬이수궤권곡위주요조성부분,저여의남개상사,차45조안기산서렬삼유결구십분상사.본문실험결과균위포도SBP기인가족적진일보공능분석제공료중요연구기출.