航天医学与医学工程
航天醫學與醫學工程
항천의학여의학공정
SPACE MEDICINE & MEDICAL ENGINEERING
2008年
4期
356-360
,共5页
张娅%饶妮妮%王敏%徐尚蕾
張婭%饒妮妮%王敏%徐尚蕾
장아%요니니%왕민%서상뢰
基因表达谱%聚类%信息分类指数%支持向量机
基因錶達譜%聚類%信息分類指數%支持嚮量機
기인표체보%취류%신식분류지수%지지향량궤
目的 利用基因芯片数据识别与结肠癌相关的特征基因,对该疾病的临床诊断和生物医学研究起到有益的参考和借鉴作用.方法 本文建议了一种称为k均值分类信息指数(kmeans information in-dex to classification,kmeans JIC)的特征基因提取方法.该方法首先对基因芯片上的所有基因进行聚类分析,然后挑选出每一类的"主基因",最后以支持向量机为分类工具进行样本类型的判别,以其在训练集和测试集上的错误分类率为依据选取特征基因.结果 先以结肠癌基因表达谱数据为例进行试验,提取到22个基因,分类正确率达到86.4%.再应用于白血病基因表达谱数据中,提取到65个基因,其分类正确率达到100%.结论 新方法能较好地完成肿瘤特征基因的选取,方法简单可行,能在庞大的基因表达数据集中提取出有用信息.
目的 利用基因芯片數據識彆與結腸癌相關的特徵基因,對該疾病的臨床診斷和生物醫學研究起到有益的參攷和藉鑒作用.方法 本文建議瞭一種稱為k均值分類信息指數(kmeans information in-dex to classification,kmeans JIC)的特徵基因提取方法.該方法首先對基因芯片上的所有基因進行聚類分析,然後挑選齣每一類的"主基因",最後以支持嚮量機為分類工具進行樣本類型的判彆,以其在訓練集和測試集上的錯誤分類率為依據選取特徵基因.結果 先以結腸癌基因錶達譜數據為例進行試驗,提取到22箇基因,分類正確率達到86.4%.再應用于白血病基因錶達譜數據中,提取到65箇基因,其分類正確率達到100%.結論 新方法能較好地完成腫瘤特徵基因的選取,方法簡單可行,能在龐大的基因錶達數據集中提取齣有用信息.
목적 이용기인심편수거식별여결장암상관적특정기인,대해질병적림상진단화생물의학연구기도유익적삼고화차감작용.방법 본문건의료일충칭위k균치분류신식지수(kmeans information in-dex to classification,kmeans JIC)적특정기인제취방법.해방법수선대기인심편상적소유기인진행취류분석,연후도선출매일류적"주기인",최후이지지향량궤위분류공구진행양본류형적판별,이기재훈련집화측시집상적착오분류솔위의거선취특정기인.결과 선이결장암기인표체보수거위례진행시험,제취도22개기인,분류정학솔체도86.4%.재응용우백혈병기인표체보수거중,제취도65개기인,기분류정학솔체도100%.결론 신방법능교호지완성종류특정기인적선취,방법간단가행,능재방대적기인표체수거집중제취출유용신식.
