中国临床康复
中國臨床康複
중국림상강복
CHINESE JOURNAL OF CLINICAL REHABILITATION
2005年
46期
26-28
,共3页
闫红%顾长国%徐发良%胡承香%葛衡江%李磊
閆紅%顧長國%徐髮良%鬍承香%葛衡江%李磊
염홍%고장국%서발량%호승향%갈형강%리뢰
分子生物学%序列分析%分子构象%肽库
分子生物學%序列分析%分子構象%肽庫
분자생물학%서렬분석%분자구상%태고
目的:利用生物信息学原理,设计针对髓样分化蛋白-2的与脂多糖结合的模拟小肽,为研制具有抗炎效应的髓样分化蛋白-2拮抗多肽奠定基础.方法:实验于2004-01/12在第三军医大学野战外科研究所第一研究室完成.采用Goldkey核酸和蛋白质分析软件及核酸和蛋白质数据光盘、PC/Gene软件系统;EMBL提供的PRS服务器、NCBI提供的BLAST服务器及Superfamily等互联网服务器,分析髓样分化蛋白-2的氨基酸序列,预测髓样分化蛋白-2的新功能,寻找髓样分化蛋白-2与脂多糖结合的关键位点.结果:①髓样分化蛋白-2的氨基酸序列功能位点信息:在96～141位氨基酸具有多达5个的功能位点.②髓样分化蛋白-2的Superfamily超家族预测:K128和K132是与脂多糖结合域的关键氨基酸,以K128-K132为中心的肽段呈现较强的亲水性,即NH2-FSKGKYKCV-COOH.结论:如果人工合成髓样分化蛋白-2与脂多糖结合域的关键序列,即"髓样分化蛋白-2模拟小肽",并以此段多肽为靶,采用噬菌体随机肽库筛选,可望得到天然髓样分化蛋白-2的拮抗多肽.
目的:利用生物信息學原理,設計針對髓樣分化蛋白-2的與脂多糖結閤的模擬小肽,為研製具有抗炎效應的髓樣分化蛋白-2拮抗多肽奠定基礎.方法:實驗于2004-01/12在第三軍醫大學野戰外科研究所第一研究室完成.採用Goldkey覈痠和蛋白質分析軟件及覈痠和蛋白質數據光盤、PC/Gene軟件繫統;EMBL提供的PRS服務器、NCBI提供的BLAST服務器及Superfamily等互聯網服務器,分析髓樣分化蛋白-2的氨基痠序列,預測髓樣分化蛋白-2的新功能,尋找髓樣分化蛋白-2與脂多糖結閤的關鍵位點.結果:①髓樣分化蛋白-2的氨基痠序列功能位點信息:在96～141位氨基痠具有多達5箇的功能位點.②髓樣分化蛋白-2的Superfamily超傢族預測:K128和K132是與脂多糖結閤域的關鍵氨基痠,以K128-K132為中心的肽段呈現較彊的親水性,即NH2-FSKGKYKCV-COOH.結論:如果人工閤成髓樣分化蛋白-2與脂多糖結閤域的關鍵序列,即"髓樣分化蛋白-2模擬小肽",併以此段多肽為靶,採用噬菌體隨機肽庫篩選,可望得到天然髓樣分化蛋白-2的拮抗多肽.
목적:이용생물신식학원리,설계침대수양분화단백-2적여지다당결합적모의소태,위연제구유항염효응적수양분화단백-2길항다태전정기출.방법:실험우2004-01/12재제삼군의대학야전외과연구소제일연구실완성.채용Goldkey핵산화단백질분석연건급핵산화단백질수거광반、PC/Gene연건계통;EMBL제공적PRS복무기、NCBI제공적BLAST복무기급Superfamily등호련망복무기,분석수양분화단백-2적안기산서렬,예측수양분화단백-2적신공능,심조수양분화단백-2여지다당결합적관건위점.결과:①수양분화단백-2적안기산서렬공능위점신식:재96～141위안기산구유다체5개적공능위점.②수양분화단백-2적Superfamily초가족예측:K128화K132시여지다당결합역적관건안기산,이K128-K132위중심적태단정현교강적친수성,즉NH2-FSKGKYKCV-COOH.결론:여과인공합성수양분화단백-2여지다당결합역적관건서렬,즉"수양분화단백-2모의소태",병이차단다태위파,채용서균체수궤태고사선,가망득도천연수양분화단백-2적길항다태.
