科学通报
科學通報
과학통보
CHINESE SCIENCE BULLETIN
2003年
18期
1944-1948
,共5页
蔡伦%薛宏%卢宏超%赵屹%朱小蓬%卜东波%凌伦奖%陈润生
蔡倫%薛宏%盧宏超%趙屹%硃小蓬%蔔東波%凌倫獎%陳潤生
채륜%설굉%로굉초%조흘%주소봉%복동파%릉륜장%진윤생
蛋白相互作用%基因表达谱%蛋白复合物%相关性%酵母
蛋白相互作用%基因錶達譜%蛋白複閤物%相關性%酵母
단백상호작용%기인표체보%단백복합물%상관성%효모
蛋白相互作用是指细胞内蛋白-蛋白间的物理相互作用, 通过酵母双杂交系统和基于质谱的蛋白吸附沉淀技术, 在酵母细胞中获得了大规模的蛋白相互作用数据.收集了文献报道的共2617个酵母蛋白的11855条相互作用.通过分析酵母细胞的大规模基因表达谱数据, 获得不同基因间表达的相关性.蛋白复合物数据也可以获得, 并能转换成蛋白两两关系数据.综合分析蛋白复合物、蛋白相互作用数据和基因表达数据可以发现三者之间的相关性.结果显示, 有相互作用或表达谱相似的蛋白都比随机抽取的蛋白同属一蛋白复合物的几率高; 并且, 有相互作用且表达谱相似的蛋白同属一蛋白复合物的几率更高.这一研究表明, 对现有的大规模蛋白复合物数据、蛋白相互作用数据和基因表达谱数据进行整合、分析, 可以揭示它们之间的关联性, 并且有助于获得这些数据蕴含的公共信息.这种研究方法对于其他的大规模数据, 如蛋白组数据、表达谱数据、蛋白的细胞定位数据和表型数据的综合分析有很好的借鉴意义.
蛋白相互作用是指細胞內蛋白-蛋白間的物理相互作用, 通過酵母雙雜交繫統和基于質譜的蛋白吸附沉澱技術, 在酵母細胞中穫得瞭大規模的蛋白相互作用數據.收集瞭文獻報道的共2617箇酵母蛋白的11855條相互作用.通過分析酵母細胞的大規模基因錶達譜數據, 穫得不同基因間錶達的相關性.蛋白複閤物數據也可以穫得, 併能轉換成蛋白兩兩關繫數據.綜閤分析蛋白複閤物、蛋白相互作用數據和基因錶達數據可以髮現三者之間的相關性.結果顯示, 有相互作用或錶達譜相似的蛋白都比隨機抽取的蛋白同屬一蛋白複閤物的幾率高; 併且, 有相互作用且錶達譜相似的蛋白同屬一蛋白複閤物的幾率更高.這一研究錶明, 對現有的大規模蛋白複閤物數據、蛋白相互作用數據和基因錶達譜數據進行整閤、分析, 可以揭示它們之間的關聯性, 併且有助于穫得這些數據蘊含的公共信息.這種研究方法對于其他的大規模數據, 如蛋白組數據、錶達譜數據、蛋白的細胞定位數據和錶型數據的綜閤分析有很好的藉鑒意義.
단백상호작용시지세포내단백-단백간적물리상호작용, 통과효모쌍잡교계통화기우질보적단백흡부침정기술, 재효모세포중획득료대규모적단백상호작용수거.수집료문헌보도적공2617개효모단백적11855조상호작용.통과분석효모세포적대규모기인표체보수거, 획득불동기인간표체적상관성.단백복합물수거야가이획득, 병능전환성단백량량관계수거.종합분석단백복합물、단백상호작용수거화기인표체수거가이발현삼자지간적상관성.결과현시, 유상호작용혹표체보상사적단백도비수궤추취적단백동속일단백복합물적궤솔고; 병차, 유상호작용차표체보상사적단백동속일단백복합물적궤솔경고.저일연구표명, 대현유적대규모단백복합물수거、단백상호작용수거화기인표체보수거진행정합、분석, 가이게시타문지간적관련성, 병차유조우획득저사수거온함적공공신식.저충연구방법대우기타적대규모수거, 여단백조수거、표체보수거、단백적세포정위수거화표형수거적종합분석유흔호적차감의의.
