生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2002年
2期
267-272
,共6页
编码序列%Fourier分析%3-碱基周期性%非3-碱基周期性
編碼序列%Fourier分析%3-堿基週期性%非3-堿基週期性
편마서렬%Fourier분석%3-감기주기성%비3-감기주기성
对12 0个较短编码序列(＜1 200 bp)的Fourier频谱进行分析表明,3-碱基周期性在短编码序列中并不是绝对存在的.统计分析提示,编码序列有无3-碱基周期性与序列的碱基组成和分布、所编码蛋白质氨基酸的选用和顺序以及同义密码子的使用都有一定的关系.一般地,非周期-3序列中A+U含量高于G+C含量,周期-3序列的情况则相反;非周期-3序列中碱基在密码子三个位点上的分布比周期-3序列中的分布均匀;非周期-3序列密码子和氨基酸的使用偏向没有周期-3序列的大.在利用Fourier分析方法预测DNA序列中的基因和外显子时,应充分考虑到这些现象.
對12 0箇較短編碼序列(＜1 200 bp)的Fourier頻譜進行分析錶明,3-堿基週期性在短編碼序列中併不是絕對存在的.統計分析提示,編碼序列有無3-堿基週期性與序列的堿基組成和分佈、所編碼蛋白質氨基痠的選用和順序以及同義密碼子的使用都有一定的關繫.一般地,非週期-3序列中A+U含量高于G+C含量,週期-3序列的情況則相反;非週期-3序列中堿基在密碼子三箇位點上的分佈比週期-3序列中的分佈均勻;非週期-3序列密碼子和氨基痠的使用偏嚮沒有週期-3序列的大.在利用Fourier分析方法預測DNA序列中的基因和外顯子時,應充分攷慮到這些現象.
대12 0개교단편마서렬(＜1 200 bp)적Fourier빈보진행분석표명,3-감기주기성재단편마서렬중병불시절대존재적.통계분석제시,편마서렬유무3-감기주기성여서렬적감기조성화분포、소편마단백질안기산적선용화순서이급동의밀마자적사용도유일정적관계.일반지,비주기-3서렬중A+U함량고우G+C함량,주기-3서렬적정황칙상반;비주기-3서렬중감기재밀마자삼개위점상적분포비주기-3서렬중적분포균균;비주기-3서렬밀마자화안기산적사용편향몰유주기-3서렬적대.재이용Fourier분석방법예측DNA서렬중적기인화외현자시,응충분고필도저사현상.
