中国公共卫生
中國公共衛生
중국공공위생
CHINA PUBLIC HEALTH
2001年
9期
769-771
,共3页
霍艳英%徐德忠%赵小宁%李如琳%杨海%杨国琦
霍豔英%徐德忠%趙小寧%李如琳%楊海%楊國琦
곽염영%서덕충%조소저%리여림%양해%양국기
丙型肝炎病毒%病毒基因%种系发生树
丙型肝炎病毒%病毒基因%種繫髮生樹
병형간염병독%병독기인%충계발생수
用反转录套式PCR(RT-PCR)法从陕西地区1例NANB型肝炎患者血清中扩增出部分E区的cDNA片段,克隆于PG-EM-T载体中用全自动序列分析仪进行双向测序,测得的序列以及已发表的同一分离株5＇NRC、C区序列,分别同Genbank中注册的36株已知基因型的HCV相应区段的序列比较,构建种系发生树.结果5＇NCR区相应序列构建的种系发生树表明该分离株为2型,而用C区和E区构建的种系发生树均表明该分离株为2a型.提示该分离株为2a型;对同一病原体来说,其基因区段的变异度不同,则种系发生树分析的结果不完全相同,变异度大的结果较准确.
用反轉錄套式PCR(RT-PCR)法從陝西地區1例NANB型肝炎患者血清中擴增齣部分E區的cDNA片段,剋隆于PG-EM-T載體中用全自動序列分析儀進行雙嚮測序,測得的序列以及已髮錶的同一分離株5＇NRC、C區序列,分彆同Genbank中註冊的36株已知基因型的HCV相應區段的序列比較,構建種繫髮生樹.結果5＇NCR區相應序列構建的種繫髮生樹錶明該分離株為2型,而用C區和E區構建的種繫髮生樹均錶明該分離株為2a型.提示該分離株為2a型;對同一病原體來說,其基因區段的變異度不同,則種繫髮生樹分析的結果不完全相同,變異度大的結果較準確.
용반전록투식PCR(RT-PCR)법종협서지구1례NANB형간염환자혈청중확증출부분E구적cDNA편단,극륭우PG-EM-T재체중용전자동서렬분석의진행쌍향측서,측득적서렬이급이발표적동일분리주5＇NRC、C구서렬,분별동Genbank중주책적36주이지기인형적HCV상응구단적서렬비교,구건충계발생수.결과5＇NCR구상응서렬구건적충계발생수표명해분리주위2형,이용C구화E구구건적충계발생수균표명해분리주위2a형.제시해분리주위2a형;대동일병원체래설,기기인구단적변이도불동,칙충계발생수분석적결과불완전상동,변이도대적결과교준학.
