植物保护学报
植物保護學報
식물보호학보
ACTA PHYTOPHYLACICA SINICA
2008年
5期
415-420
,共6页
马进%宋云枝%李开东%朱常香%温孚江
馬進%宋雲枝%李開東%硃常香%溫孚江
마진%송운지%리개동%주상향%온부강
水稻条纹病毒%RNA3%RNA4%序列分析%分子变异
水稻條紋病毒%RNA3%RNA4%序列分析%分子變異
수도조문병독%RNA3%RNA4%서렬분석%분자변이
为从分子水平探讨强致病性水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2的变异及其致病性,采用RT-PCR技术,克隆RSV-SD-JN2的RNA3、RNA4区段cDNA.结果显示,RSV-SD-JN2的RNA3和RNA4核苷酸序列长度分别为2487、2157bp;RNA3中,NS3基因长为636bp,基因间隔区(IR)为725bp,CP基因为969bp;RNA4中,SP基因长为537bp,基因间隔区(IR)为654bp,NSvc4基因为861bp.不同时期、不同区域和不同致病性的RSV分离物的序列比较发现,RNA3、RNA4序列5′和3′末端非编码区具有高度保守性,仅存在个别碱基的差异;基因编码区保守性较高,核苷酸和氨基酸序列同源性分别在93%和97%以上,且大部分碱基变异为无意义变异;基因间隔区(IR)易于变异.RSV的分子变异与其地理分布具有密切的关系.RNA4的IR的变异导致RNA二级结构--发夹结构的稳定性提高是病毒致病性增强的重要原因.
為從分子水平探討彊緻病性水稻條紋病毒山東濟寧分離物RSV-SD-JN2的變異及其緻病性,採用RT-PCR技術,剋隆RSV-SD-JN2的RNA3、RNA4區段cDNA.結果顯示,RSV-SD-JN2的RNA3和RNA4覈苷痠序列長度分彆為2487、2157bp;RNA3中,NS3基因長為636bp,基因間隔區(IR)為725bp,CP基因為969bp;RNA4中,SP基因長為537bp,基因間隔區(IR)為654bp,NSvc4基因為861bp.不同時期、不同區域和不同緻病性的RSV分離物的序列比較髮現,RNA3、RNA4序列5′和3′末耑非編碼區具有高度保守性,僅存在箇彆堿基的差異;基因編碼區保守性較高,覈苷痠和氨基痠序列同源性分彆在93%和97%以上,且大部分堿基變異為無意義變異;基因間隔區(IR)易于變異.RSV的分子變異與其地理分佈具有密切的關繫.RNA4的IR的變異導緻RNA二級結構--髮夾結構的穩定性提高是病毒緻病性增彊的重要原因.
위종분자수평탐토강치병성수도조문병독산동제저분리물RSV-SD-JN2적변이급기치병성,채용RT-PCR기술,극륭RSV-SD-JN2적RNA3、RNA4구단cDNA.결과현시,RSV-SD-JN2적RNA3화RNA4핵감산서렬장도분별위2487、2157bp;RNA3중,NS3기인장위636bp,기인간격구(IR)위725bp,CP기인위969bp;RNA4중,SP기인장위537bp,기인간격구(IR)위654bp,NSvc4기인위861bp.불동시기、불동구역화불동치병성적RSV분리물적서렬비교발현,RNA3、RNA4서렬5′화3′말단비편마구구유고도보수성,부존재개별감기적차이;기인편마구보수성교고,핵감산화안기산서렬동원성분별재93%화97%이상,차대부분감기변이위무의의변이;기인간격구(IR)역우변이.RSV적분자변이여기지리분포구유밀절적관계.RNA4적IR적변이도치RNA이급결구--발협결구적은정성제고시병독치병성증강적중요원인.
