大连海洋大学学报
大連海洋大學學報
대련해양대학학보
JOURNAL OF DALIAN FISHERIES UNIVERSITY
2011年
3期
243-246
,共4页
马悦欣%王颖%杨凤%闫喜武%霍忠明
馬悅訢%王穎%楊鳳%閆喜武%霍忠明
마열흔%왕영%양봉%염희무%곽충명
四角蛤蜊%PCR-DGGE%细菌多样性
四角蛤蜊%PCR-DGGE%細菌多樣性
사각합리%PCR-DGGE%세균다양성
应用PCR-DGGE技术对盘锦某滩涂四角蛤蜊Mactra venerformis体内的细菌多样性进行了分析.使用SDS裂解法提取样品的总DNA,采用大多数细菌通用引物F338GC/R518从总DNA中成功扩增出16S rDNA片段,然后对PCR产物进行DGGE分析,并将DGGE图谱上部分条带回收、再扩增、克隆和测序;将所测序列在GenBank核酸数据库中进行检索,用BLASTN分析DNA序列获得相似性最近的细菌.DGGE图谱显示,四角蛤蜊体内的细菌种类比较丰富,且不同时间样品细菌的优势菌群结构有一定的差异.将所测条带序列进行比对,结果表明,细菌种群中包括支原体属Mycoplasma、假单胞菌属Pseudomonas、弧菌属Vibrio、红球菌属Rhodococcus 和鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas及不可培养的细菌.
應用PCR-DGGE技術對盤錦某灘塗四角蛤蜊Mactra venerformis體內的細菌多樣性進行瞭分析.使用SDS裂解法提取樣品的總DNA,採用大多數細菌通用引物F338GC/R518從總DNA中成功擴增齣16S rDNA片段,然後對PCR產物進行DGGE分析,併將DGGE圖譜上部分條帶迴收、再擴增、剋隆和測序;將所測序列在GenBank覈痠數據庫中進行檢索,用BLASTN分析DNA序列穫得相似性最近的細菌.DGGE圖譜顯示,四角蛤蜊體內的細菌種類比較豐富,且不同時間樣品細菌的優勢菌群結構有一定的差異.將所測條帶序列進行比對,結果錶明,細菌種群中包括支原體屬Mycoplasma、假單胞菌屬Pseudomonas、弧菌屬Vibrio、紅毬菌屬Rhodococcus 和鞘氨醇單胞菌屬Sphingomonas及不可培養的細菌.
응용PCR-DGGE기술대반금모탄도사각합리Mactra venerformis체내적세균다양성진행료분석.사용SDS렬해법제취양품적총DNA,채용대다수세균통용인물F338GC/R518종총DNA중성공확증출16S rDNA편단,연후대PCR산물진행DGGE분석,병장DGGE도보상부분조대회수、재확증、극륭화측서;장소측서렬재GenBank핵산수거고중진행검색,용BLASTN분석DNA서렬획득상사성최근적세균.DGGE도보현시,사각합리체내적세균충류비교봉부,차불동시간양품세균적우세균군결구유일정적차이.장소측조대서렬진행비대,결과표명,세균충군중포괄지원체속Mycoplasma、가단포균속Pseudomonas、호균속Vibrio、홍구균속Rhodococcus 화초안순단포균속Sphingomonas급불가배양적세균.
