CAJ | 학술논문

以CLONTEECH的pDNR-LIB质粒为载体,构建了干旱和盐碱共胁迫48h和相应的无胁迫正常生长条件下耐旱玉米(Zea mays L.) YQ7-96品系的雌雄分化期(12片叶龄)的混合组织(叶、茎和花器)EST文库.该文库容量>2×105个克隆,覆盖了预计的玉米基因组5万个基因的4倍以上.随机对3 168个克隆中插入的cDNA进行测序, 获得有效序列2 098条,其中,2 002个克隆中的cDNA进行了5'端测序,96个克隆中的cDNA的进行了5'和3'两端测序.结果表明,3'端测序的96个克隆的cDNA都含有poly A尾巴;进一步对这2 098条组装分析,形成168个重叠群(Contig)和1 693个单拷贝EST(Singlet),代表了共计1 861条独立基因(Unigene);根据GenBank 中的玉米EST数据库和 BLASTn分析软件进行核苷酸同源性分析,1 731条(93.01%)EST的score值大于或等于100, 130条(6.99%)的EST的score值小于100,说明这130条属于新的表达基因的序列,有21条可以定位在玉米的不同染色体上; BLASTx分析表明,2 098条EST中,1 007条(48%)有功能注释信息,1 091条(52%)无功能注释信息.该文库中的EST将会对公共数据库中现存的玉米EST数据起到补充作用.
이CLONTEECH적pDNR-LIB질립위재체,구건료간한화염감공협박48h화상응적무협박정상생장조건하내한옥미(Zea mays L.) YQ7-96품계적자웅분화기(12편협령)적혼합조직(협、경화화기)EST문고.해문고용량>2×105개극륭,복개료예계적옥미기인조5만개기인적4배이상.수궤대3 168개극륭중삽입적cDNA진행측서, 획득유효서렬2 098조,기중,2 002개극륭중적cDNA진행료5'단측서,96개극륭중적cDNA적진행료5'화3'량단측서.결과표명,3'단측서적96개극륭적cDNA도함유poly A미파;진일보대저2 098조조장분석,형성168개중첩군(Contig)화1 693개단고패EST(Singlet),대표료공계1 861조독립기인(Unigene);근거GenBank 중적옥미EST수거고화 BLASTn분석연건진행핵감산동원성분석,1 731조(93.01%)EST적score치대우혹등우100, 130조(6.99%)적EST적score치소우100,설명저130조속우신적표체기인적서렬,유21조가이정위재옥미적불동염색체상; BLASTx분석표명,2 098조EST중,1 007조(48%)유공능주석신식,1 091조(52%)무공능주석신식.해문고중적EST장회대공공수거고중현존적옥미EST수거기도보충작용.