云南农业大学学报
雲南農業大學學報
운남농업대학학보
JOURNAL OF YUNNAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2011年
2期
173-176
,共4页
刘林%胡燕玲%杨静%张庆%李进斌%李成云
劉林%鬍燕玲%楊靜%張慶%李進斌%李成雲
류림%호연령%양정%장경%리진빈%리성운
小麦条锈病菌%表达序列标签%微卫星
小麥條鏽病菌%錶達序列標籤%微衛星
소맥조수병균%표체서렬표첨%미위성
研究利用已公布的7 368条小麦条锈病菌表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,对其EST序列中的微卫星(microsatellite)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)进行了系统分析.结果表明,在已公布的7 368条小麦条锈病菌EST序列中,共有2642个SSR序列(长度大于15 bp,匹配值大于80%),相当于平均3条EST序列中分布有1个SSR序列.在这些SSR中,单碱基SSR最多,数量达2 320个,占SSR总数的87.8%;其次为三碱基SSR,数量为137个,约占SSR总数的5.2%;五碱基重复的SSR数量最少,为34个.且有的SSR的重复数较多,这将有利于小麦条锈病菌SSR分子标记的开发与应用.
研究利用已公佈的7 368條小麥條鏽病菌錶達序列標籤(expressed sequence tags,EST)序列,對其EST序列中的微衛星(microsatellite)或簡單重複序列(simple sequence repeats,SSRs)進行瞭繫統分析.結果錶明,在已公佈的7 368條小麥條鏽病菌EST序列中,共有2642箇SSR序列(長度大于15 bp,匹配值大于80%),相噹于平均3條EST序列中分佈有1箇SSR序列.在這些SSR中,單堿基SSR最多,數量達2 320箇,佔SSR總數的87.8%;其次為三堿基SSR,數量為137箇,約佔SSR總數的5.2%;五堿基重複的SSR數量最少,為34箇.且有的SSR的重複數較多,這將有利于小麥條鏽病菌SSR分子標記的開髮與應用.
연구이용이공포적7 368조소맥조수병균표체서렬표첨(expressed sequence tags,EST)서렬,대기EST서렬중적미위성(microsatellite)혹간단중복서렬(simple sequence repeats,SSRs)진행료계통분석.결과표명,재이공포적7 368조소맥조수병균EST서렬중,공유2642개SSR서렬(장도대우15 bp,필배치대우80%),상당우평균3조EST서렬중분포유1개SSR서렬.재저사SSR중,단감기SSR최다,수량체2 320개,점SSR총수적87.8%;기차위삼감기SSR,수량위137개,약점SSR총수적5.2%;오감기중복적SSR수량최소,위34개.차유적SSR적중복수교다,저장유리우소맥조수병균SSR분자표기적개발여응용.
