CAJ | 학술논문

为揭示国内新型鸭肝炎病毒(DHV)基因组3'末端的序列特点,用3'RACE和RT-PCR克隆DHV分离株C-GY株的基因组3'末端序列,并以GenBank中已知全序列的22株DHV作为参照,进行比较分析.结果表明,C_GY株基因组3'末端包含1 359 nt的3D、终止密码子TAA、366 nt的3'UTR和15 nt的poly(A).与其他DHV相同之处:C-GY的3D蛋白含453个氨基酸,亦包含小RNA病毒RNA聚合酶的5个特征基序.C-GY的3'UTR长度与台湾新型DHV相同,仅比韩国新型缺少1个C,但比DHV血清1型(DHV-1)长52 nt.分析3D和3'UTR核苷酸序列,可见C-GY与16株DHV-1之间同源性为75%～77%和66%～68%、与2株台湾新型DHV之间为80%和91%、与4株韩国新型之间为96%～97%和96%～97%,表明C-GY与韩国新型DHV具有相近的遗传关系,C-GY株与本实验中参考DHV属于小RNA病毒科的同一个未命名的新属,而且C-GY属于DHV的基因C型,也说明新型DHV与DHV-1的基因组3'末端存在较高的序列变异性.
위게시국내신형압간염병독(DHV)기인조3'말단적서렬특점,용3'RACE화RT-PCR극륭DHV분리주C-GY주적기인조3'말단서렬,병이GenBank중이지전서렬적22주DHV작위삼조,진행비교분석.결과표명,C_GY주기인조3'말단포함1 359 nt적3D、종지밀마자TAA、366 nt적3'UTR화15 nt적poly(A).여기타DHV상동지처:C-GY적3D단백함453개안기산,역포함소RNA병독RNA취합매적5개특정기서.C-GY적3'UTR장도여태만신형DHV상동,부비한국신형결소1개C,단비DHV혈청1형(DHV-1)장52 nt.분석3D화3'UTR핵감산서렬,가견C-GY여16주DHV-1지간동원성위75%～77%화66%～68%、여2주태만신형DHV지간위80%화91%、여4주한국신형지간위96%～97%화96%～97%,표명C-GY여한국신형DHV구유상근적유전관계,C-GY주여본실험중삼고DHV속우소RNA병독과적동일개미명명적신속,이차C-GY속우DHV적기인C형,야설명신형DHV여DHV-1적기인조3'말단존재교고적서렬변이성.