物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2009年
4期
677-683
,共7页
力场参数%分子动力学模拟%红外光谱
力場參數%分子動力學模擬%紅外光譜
력장삼수%분자동역학모의%홍외광보
以量子化学计算作为起点,为最简单的糖类分子--乙醇醛开发了两套分子力学力场参数:基于肽类的力场和基于醛类的力场.分子动力学模拟结果表明,所开发的类醛力场参数能够较好地描述乙醇醛分子在水中的结构以及水分子在其周围的分布.通过瞬时简正模式分析,得到了3N-6个模式的瞬时振动频率和振动跃迁偶极矩等振动光谱参数的统计分布及其相关性.结合量子化学计算和分子动力学模拟对生物分子体系的多元振动光谱参数进行预测和评估,为从化学键水平出发模拟宽带飞秒二维红外相关光谱提供了一个新方法.
以量子化學計算作為起點,為最簡單的糖類分子--乙醇醛開髮瞭兩套分子力學力場參數:基于肽類的力場和基于醛類的力場.分子動力學模擬結果錶明,所開髮的類醛力場參數能夠較好地描述乙醇醛分子在水中的結構以及水分子在其週圍的分佈.通過瞬時簡正模式分析,得到瞭3N-6箇模式的瞬時振動頻率和振動躍遷偶極矩等振動光譜參數的統計分佈及其相關性.結閤量子化學計算和分子動力學模擬對生物分子體繫的多元振動光譜參數進行預測和評估,為從化學鍵水平齣髮模擬寬帶飛秒二維紅外相關光譜提供瞭一箇新方法.
이양자화학계산작위기점,위최간단적당류분자--을순철개발료량투분자역학력장삼수:기우태류적력장화기우철류적력장.분자동역학모의결과표명,소개발적류철력장삼수능구교호지묘술을순철분자재수중적결구이급수분자재기주위적분포.통과순시간정모식분석,득도료3N-6개모식적순시진동빈솔화진동약천우겁구등진동광보삼수적통계분포급기상관성.결합양자화학계산화분자동역학모의대생물분자체계적다원진동광보삼수진행예측화평고,위종화학건수평출발모의관대비초이유홍외상관광보제공료일개신방법.