中华实验和临床病毒学杂志
中華實驗和臨床病毒學雜誌
중화실험화림상병독학잡지
CHINESE JOURNAL OF EXPERIMENTAL AND CLINICAL VIROLOGY
2006年
3期
203-208
,共6页
王环宇%潘晓玲%付士红%王雷%李铭华%Ichiro KURANE%梁国栋
王環宇%潘曉玲%付士紅%王雷%李銘華%Ichiro KURANE%樑國棟
왕배우%반효령%부사홍%왕뢰%리명화%Ichiro KURANE%량국동
脑炎病毒,日本%基因%种系发生
腦炎病毒,日本%基因%種繫髮生
뇌염병독,일본%기인%충계발생
目的 对我国新分离乙脑病毒02-76株进行全基因序列测定和分析,了解乙脑病毒基因组结构及毒力特性.方法 设计乙脑病毒全基因组扩增引物,RT-PCR扩增片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因序列.通过Clustal X(1.8)、DNASTAR、GENEDOC(3.2)等生物学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析.结果 新分离乙脑病毒02-76株全基因组全长10 977个核苷酸,从96位到10 391位,共10 296个核苷酸编码一个开放阅读框,编码3432个氨基酸.与我国1949年分离的Beijing-1株相比较共存在248个核苷酸差异,16个氨基酸差异.与GenBank中选择的29株乙脑病毒全基因序列比较发现,其核苷酸总体差异率为0.6%～15.1%,氨基酸总体差异率为0.2%～4.6%.通过PrM/C区段、E区段、3'NTR区段及全基因序列进行系统进化分析均显示该毒株属于基因3型乙脑病毒.结论 新分离的乙脑病毒02-76株属于基因3型,与中国分离株SA-14进化关系最接近.
目的 對我國新分離乙腦病毒02-76株進行全基因序列測定和分析,瞭解乙腦病毒基因組結構及毒力特性.方法 設計乙腦病毒全基因組擴增引物,RT-PCR擴增片段,PCR產物直接測序,拼接後穫得全基因序列.通過Clustal X(1.8)、DNASTAR、GENEDOC(3.2)等生物學軟件進行覈苷痠序列及氨基痠序列分析和病毒的繫統進化分析.結果 新分離乙腦病毒02-76株全基因組全長10 977箇覈苷痠,從96位到10 391位,共10 296箇覈苷痠編碼一箇開放閱讀框,編碼3432箇氨基痠.與我國1949年分離的Beijing-1株相比較共存在248箇覈苷痠差異,16箇氨基痠差異.與GenBank中選擇的29株乙腦病毒全基因序列比較髮現,其覈苷痠總體差異率為0.6%～15.1%,氨基痠總體差異率為0.2%～4.6%.通過PrM/C區段、E區段、3'NTR區段及全基因序列進行繫統進化分析均顯示該毒株屬于基因3型乙腦病毒.結論 新分離的乙腦病毒02-76株屬于基因3型,與中國分離株SA-14進化關繫最接近.
목적 대아국신분리을뇌병독02-76주진행전기인서렬측정화분석,료해을뇌병독기인조결구급독력특성.방법 설계을뇌병독전기인조확증인물,RT-PCR확증편단,PCR산물직접측서,병접후획득전기인서렬.통과Clustal X(1.8)、DNASTAR、GENEDOC(3.2)등생물학연건진행핵감산서렬급안기산서렬분석화병독적계통진화분석.결과 신분리을뇌병독02-76주전기인조전장10 977개핵감산,종96위도10 391위,공10 296개핵감산편마일개개방열독광,편마3432개안기산.여아국1949년분리적Beijing-1주상비교공존재248개핵감산차이,16개안기산차이.여GenBank중선택적29주을뇌병독전기인서렬비교발현,기핵감산총체차이솔위0.6%～15.1%,안기산총체차이솔위0.2%～4.6%.통과PrM/C구단、E구단、3'NTR구단급전기인서렬진행계통진화분석균현시해독주속우기인3형을뇌병독.결론 신분리적을뇌병독02-76주속우기인3형,여중국분리주SA-14진화관계최접근.
