CAJ | 학술논문

目的了解我国HIV感染者p24蛋白编码区的基因变异情况.方法收集我国河南及上海地区28份已经证实的HIV-1感染患者的血浆标本并抽提出RNA;采用逆转录和Nested-PCR的方法扩增所需的目的基因,使用DNA测序仪直接测序;应用CLUSTAL W、PHYLIP等软件包对序列进行比对及进化树分析.结果 28份gag样本中25份为B亚型,3份为A亚型.与共享序列相比,25例B亚型的p24编码区中发生核苷酸改变的位点比例为0.4%～4.8%,平均为1.4%,其中A→G占20.5%,G→A占17.3%;3例A亚型发生核苷酸改变的位点比例平均为0.24%.在所有变异位点中均未发现G→A的高度突变.B亚型和A亚型内的基因离散率平均为2.9%和0.58%,A亚型与B亚型之间的基因离散率平均为11.1%.25例B亚型根据基因序列所推测的p24蛋白发生氨基酸改变的比例为0.4%～5.2%,平均为2.2%.进化树分析表明在我国河南地区HIV感染B亚型多为与泰国株相近的B'亚型.结论 HIV-1p24编码区仍相对保守,选择无变异发生的区域有助于免疫治疗及疫苗研制等方面的研究.
목적료해아국HIV감염자p24단백편마구적기인변이정황.방법수집아국하남급상해지구28빈이경증실적HIV-1감염환자적혈장표본병추제출RNA;채용역전록화Nested-PCR적방법확증소수적목적기인,사용DNA측서의직접측서;응용CLUSTAL W、PHYLIP등연건포대서렬진행비대급진화수분석.결과 28빈gag양본중25빈위B아형,3빈위A아형.여공향서렬상비,25례B아형적p24편마구중발생핵감산개변적위점비례위0.4%～4.8%,평균위1.4%,기중A→G점20.5%,G→A점17.3%;3례A아형발생핵감산개변적위점비례평균위0.24%.재소유변이위점중균미발현G→A적고도돌변.B아형화A아형내적기인리산솔평균위2.9%화0.58%,A아형여B아형지간적기인리산솔평균위11.1%.25례B아형근거기인서렬소추측적p24단백발생안기산개변적비례위0.4%～5.2%,평균위2.2%.진화수분석표명재아국하남지구HIV감염B아형다위여태국주상근적B'아형.결론 HIV-1p24편마구잉상대보수,선택무변이발생적구역유조우면역치료급역묘연제등방면적연구.