海南大学学报(自然科学版)
海南大學學報(自然科學版)
해남대학학보(자연과학판)
NATURAL SCIENCE JOURNAL OF HAINAN UNIVERSITY
2009年
2期
134-138,143
,共6页
刘涛%申明霞%杜丽%程立生%王凤阳%成鹰%李治深
劉濤%申明霞%杜麗%程立生%王鳳暘%成鷹%李治深
류도%신명하%두려%정립생%왕봉양%성응%리치심
五指山小型猪%cDNA文库%蛋白酶体亚基α型6%克隆%生物信息学分析
五指山小型豬%cDNA文庫%蛋白酶體亞基α型6%剋隆%生物信息學分析
오지산소형저%cDNA문고%단백매체아기α형6%극륭%생물신식학분석
为了对海南五指山小型猪蛋白酶体亚基α型6(pmteasome subunit Mpha type 6,PMSA6)cDNA基因进行克隆和生物信息学分析,笔者以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR方法,克隆得到PMSA6全长cDNA,并向GenBank递交了该序列(登录号:FJ358606).同时运用生物信息学软件对该基因核苷酸序列进行了分析,并预测了其编码蛋白的理化性质及二级结构等.生物信息学分析表明:该cDNA全长1029 bp,5'非翻译区长96 bp,3'非翻译区长192 bp,含有一个741 bp完整的开放阅读框,编码246个氨基酸.该蛋白的分子量为37.680 kD,等电点为8.76.进一步比对分析发现,五指山小型猪PMSA6基因的核酸序列及其氨基酸序列与人、牛等哺乳动物具有很高的相似性.本研究成功克隆了海南五指山小型猪PMSA6基因cDNA,并进行了相关生物信息学分析,为进一步研究PMSA6在动物体内的作用机理奠定了基础.
為瞭對海南五指山小型豬蛋白酶體亞基α型6(pmteasome subunit Mpha type 6,PMSA6)cDNA基因進行剋隆和生物信息學分析,筆者以構建的五指山小型豬外週血白細胞cDNA文庫為材料,採用菌落PCR方法,剋隆得到PMSA6全長cDNA,併嚮GenBank遞交瞭該序列(登錄號:FJ358606).同時運用生物信息學軟件對該基因覈苷痠序列進行瞭分析,併預測瞭其編碼蛋白的理化性質及二級結構等.生物信息學分析錶明:該cDNA全長1029 bp,5'非翻譯區長96 bp,3'非翻譯區長192 bp,含有一箇741 bp完整的開放閱讀框,編碼246箇氨基痠.該蛋白的分子量為37.680 kD,等電點為8.76.進一步比對分析髮現,五指山小型豬PMSA6基因的覈痠序列及其氨基痠序列與人、牛等哺乳動物具有很高的相似性.本研究成功剋隆瞭海南五指山小型豬PMSA6基因cDNA,併進行瞭相關生物信息學分析,為進一步研究PMSA6在動物體內的作用機理奠定瞭基礎.
위료대해남오지산소형저단백매체아기α형6(pmteasome subunit Mpha type 6,PMSA6)cDNA기인진행극륭화생물신식학분석,필자이구건적오지산소형저외주혈백세포cDNA문고위재료,채용균락PCR방법,극륭득도PMSA6전장cDNA,병향GenBank체교료해서렬(등록호:FJ358606).동시운용생물신식학연건대해기인핵감산서렬진행료분석,병예측료기편마단백적이화성질급이급결구등.생물신식학분석표명:해cDNA전장1029 bp,5'비번역구장96 bp,3'비번역구장192 bp,함유일개741 bp완정적개방열독광,편마246개안기산.해단백적분자량위37.680 kD,등전점위8.76.진일보비대분석발현,오지산소형저PMSA6기인적핵산서렬급기안기산서렬여인、우등포유동물구유흔고적상사성.본연구성공극륭료해남오지산소형저PMSA6기인cDNA,병진행료상관생물신식학분석,위진일보연구PMSA6재동물체내적작용궤리전정료기출.
