华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2011年
1期
99-104
,共6页
高慧%刘海军%黄亚群%陈景堂%祝丽英%赵永锋%张祖新
高慧%劉海軍%黃亞群%陳景堂%祝麗英%趙永鋒%張祖新
고혜%류해군%황아군%진경당%축려영%조영봉%장조신
玉米%寡肽转运蛋白(OPT)%克隆%生物信息学分析
玉米%寡肽轉運蛋白(OPT)%剋隆%生物信息學分析
옥미%과태전운단백(OPT)%극륭%생물신식학분석
根据玉米B73和水稻的寡肽转运蛋白全长序列设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法从玉米自交系478中克隆到了寡肽转运蛋白基因,命名为ZmOPT0212(Accession number:HM021150).ZmOPT0212开放阅读框为2 151 bp,编码716个氨基酸残基,等电点8.87,相对分子质量为77.4 kDa.预测由该基因转录的寡肽转运蛋白其二级结构约含43.85%的α-螺旋、13.27%的延伸链、3.91%的β-转角和38.97%的不规则卷曲,含有14个连续的疏水片断,其中12个可能构成跨膜螺旋;预测该转运蛋白不存在信号肽,亚细胞定位存在于细胞膜上.同源性和进化树的预测分析显示,ZmOPT0212蛋白与水稻、拟南芥、毛果杨和蓖麻等高等植物的寡肽转运蛋白同源性分别达到了99%,96%,92%和92%,所转运的底物除有寡肽外,还包含有金属离子、金属离子-烟草胺的螯合物等.
根據玉米B73和水稻的寡肽轉運蛋白全長序列設計引物,通過RT-PCR直接擴增的方法從玉米自交繫478中剋隆到瞭寡肽轉運蛋白基因,命名為ZmOPT0212(Accession number:HM021150).ZmOPT0212開放閱讀框為2 151 bp,編碼716箇氨基痠殘基,等電點8.87,相對分子質量為77.4 kDa.預測由該基因轉錄的寡肽轉運蛋白其二級結構約含43.85%的α-螺鏇、13.27%的延伸鏈、3.91%的β-轉角和38.97%的不規則捲麯,含有14箇連續的疏水片斷,其中12箇可能構成跨膜螺鏇;預測該轉運蛋白不存在信號肽,亞細胞定位存在于細胞膜上.同源性和進化樹的預測分析顯示,ZmOPT0212蛋白與水稻、擬南芥、毛果楊和蓖痳等高等植物的寡肽轉運蛋白同源性分彆達到瞭99%,96%,92%和92%,所轉運的底物除有寡肽外,還包含有金屬離子、金屬離子-煙草胺的螯閤物等.
근거옥미B73화수도적과태전운단백전장서렬설계인물,통과RT-PCR직접확증적방법종옥미자교계478중극륭도료과태전운단백기인,명명위ZmOPT0212(Accession number:HM021150).ZmOPT0212개방열독광위2 151 bp,편마716개안기산잔기,등전점8.87,상대분자질량위77.4 kDa.예측유해기인전록적과태전운단백기이급결구약함43.85%적α-라선、13.27%적연신련、3.91%적β-전각화38.97%적불규칙권곡,함유14개련속적소수편단,기중12개가능구성과막라선;예측해전운단백불존재신호태,아세포정위존재우세포막상.동원성화진화수적예측분석현시,ZmOPT0212단백여수도、의남개、모과양화비마등고등식물적과태전운단백동원성분별체도료99%,96%,92%화92%,소전운적저물제유과태외,환포함유금속리자、금속리자-연초알적오합물등.
