CAJ | 학술논문

根据猪SLA-DQA基因cDNA序列和人HLA-DQA基因组序列设计引物,在猪中成功扩增了一个731 bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子,通过克隆和PCR直接测序获得该片段的核苷酸序列.在家系中对第2外显子的核苷酸序列和其编码的α1结构域的氨基酸序列进行了分析,并与GenBank中所有的SLA-DQA第2外显子序列进行比较分析,发现有4个新突变位点和两个新等位基因存在.新等位基因分别是DQA-SLT 26和DQA-TC 21-1.DQA-SLT 26与单倍型c、d相比有8个核苷酸的差异和4个氨基酸的改变:单倍型c、d在60、65、81、93位的氨基酸分别是Val、Lys、Asp、Lys;而DQA-SLT 26相应的氨基酸是Ala、Glu、Gly、Ile.DQA-TC 21-1与单倍型c、d相比存在1个氨基酸的改变,由单倍型c和d中94位氨基酸His变为Tyr.
근거저SLA-DQA기인cDNA서렬화인HLA-DQA기인조서렬설계인물,재저중성공확증료일개731 bp적편단,해편단포괄저SLA-DQA기인적대부분제2외현자、완정제2내함자화소부분제3외현자,통과극륭화PCR직접측서획득해편단적핵감산서렬.재가계중대제2외현자적핵감산서렬화기편마적α1결구역적안기산서렬진행료분석,병여GenBank중소유적SLA-DQA제2외현자서렬진행비교분석,발현유4개신돌변위점화량개신등위기인존재.신등위기인분별시DQA-SLT 26화DQA-TC 21-1.DQA-SLT 26여단배형c、d상비유8개핵감산적차이화4개안기산적개변:단배형c、d재60、65、81、93위적안기산분별시Val、Lys、Asp、Lys;이DQA-SLT 26상응적안기산시Ala、Glu、Gly、Ile.DQA-TC 21-1여단배형c、d상비존재1개안기산적개변,유단배형c화d중94위안기산His변위Tyr.