生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2011年
6期
104-111
,共8页
三角帆蚌%组织蛋白酶L%基因克隆%进化分析
三角帆蚌%組織蛋白酶L%基因剋隆%進化分析
삼각범방%조직단백매L%기인극륭%진화분석
组织蛋白酶L在多种生理过程中具有重要作用.根据本实验室构建的三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE方法克隆了三角帆蚌组织蛋白酶L基因的cDNA全序列(GenBank登录号为HQ610996).结果表明,该序列全长为1 105 bp,包括24 bp的5'-末端非转录区,1 002 bp的开放阅读框和79 bp的3'-末端非转录区,共编码333个氨基酸,包含1个由20个氨基酸组成的信号肽.推测的三角帆蚌组织蛋白酶L前体肽具有组织蛋白酶前体抑制因子功能结构域,具有组织蛋白酶L家族高度保守结构基序ERFNIN[E-X3-R-X2-(I/V)-F-X3-N-X3-I-X3-N]、GNFD和GCXGG;该蛋白的半胱氨酸类蛋白酶半胱氨酸、组氨酸和天冬氨酸活性位点均高度保守.同源性分析表明,推测的三角帆蚌组织蛋白酶L氨基酸序列与其他贝类高度保守,同源性在60%-74%之间.进化分析显示,三角帆蚌组织蛋白酶L与其他贝类组织蛋白酶L聚为一支,在该支中,三角帆蚌与软体动物淡水螺(R.peregra)的亲缘关系最近.本研究结果为进一步研究三角帆蚌组织蛋白酶L的生理功能提供基础资料.
組織蛋白酶L在多種生理過程中具有重要作用.根據本實驗室構建的三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)cDNA文庫中已標註的EST序列,利用RACE方法剋隆瞭三角帆蚌組織蛋白酶L基因的cDNA全序列(GenBank登錄號為HQ610996).結果錶明,該序列全長為1 105 bp,包括24 bp的5'-末耑非轉錄區,1 002 bp的開放閱讀框和79 bp的3'-末耑非轉錄區,共編碼333箇氨基痠,包含1箇由20箇氨基痠組成的信號肽.推測的三角帆蚌組織蛋白酶L前體肽具有組織蛋白酶前體抑製因子功能結構域,具有組織蛋白酶L傢族高度保守結構基序ERFNIN[E-X3-R-X2-(I/V)-F-X3-N-X3-I-X3-N]、GNFD和GCXGG;該蛋白的半胱氨痠類蛋白酶半胱氨痠、組氨痠和天鼕氨痠活性位點均高度保守.同源性分析錶明,推測的三角帆蚌組織蛋白酶L氨基痠序列與其他貝類高度保守,同源性在60%-74%之間.進化分析顯示,三角帆蚌組織蛋白酶L與其他貝類組織蛋白酶L聚為一支,在該支中,三角帆蚌與軟體動物淡水螺(R.peregra)的親緣關繫最近.本研究結果為進一步研究三角帆蚌組織蛋白酶L的生理功能提供基礎資料.
조직단백매L재다충생리과정중구유중요작용.근거본실험실구건적삼각범방(Hyriopsis cumingii)cDNA문고중이표주적EST서렬,이용RACE방법극륭료삼각범방조직단백매L기인적cDNA전서렬(GenBank등록호위HQ610996).결과표명,해서렬전장위1 105 bp,포괄24 bp적5'-말단비전록구,1 002 bp적개방열독광화79 bp적3'-말단비전록구,공편마333개안기산,포함1개유20개안기산조성적신호태.추측적삼각범방조직단백매L전체태구유조직단백매전체억제인자공능결구역,구유조직단백매L가족고도보수결구기서ERFNIN[E-X3-R-X2-(I/V)-F-X3-N-X3-I-X3-N]、GNFD화GCXGG;해단백적반광안산류단백매반광안산、조안산화천동안산활성위점균고도보수.동원성분석표명,추측적삼각범방조직단백매L안기산서렬여기타패류고도보수,동원성재60%-74%지간.진화분석현시,삼각범방조직단백매L여기타패류조직단백매L취위일지,재해지중,삼각범방여연체동물담수라(R.peregra)적친연관계최근.본연구결과위진일보연구삼각범방조직단백매L적생리공능제공기출자료.
