石河子大学学报（自然科学版）
石河子大學學報（自然科學版）
석하자대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHIHEZI UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE)
2011年
3期
296-300
,共5页
绵羊%FGF5基因%蛋白质结构%生物信息学%抗原表位
綿羊%FGF5基因%蛋白質結構%生物信息學%抗原錶位
면양%FGF5기인%단백질결구%생물신식학%항원표위
为了应用生物信息学分析绵羊FGF5基因编码蛋白的结构与抗原表位,预测该蛋白的免疫原性.根据牛的FGF5基因cDNA保守区序列设计引物对绵羊FGF5基因cDNA进行扩增,将扩增片段进行克隆和测序,并与牛的FG F5基因序列进行同源性比较,确定扩增的片段为绵羊FGF5基因片段.利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、Motif Scan、SWISS-MODEL等生物信息学在线分析程序,结合TMH-MM2.0、SignalP3.0、TargetP l.1和PSORTⅡprediction、Gene Runner和DNAMAN等生物信息学软件,分析、预测FGF5蛋白的理化性质、可溶性、翻译后修饰位点、亲(疏)水性、跨膜区、信号肽序列、蛋白细胞定位区域、二级结构、抗原表位等.结果显示该蛋白由270个氨基酸组成,分子式C1315 H2085 N389 O378 S6,分子质量单位为29.5847 ku,理论等电点为10.59,波长280 nm时的吸光度(A)值为0.864,半衰期为30 h,22个翻译后修饰位点、多个亲水性高的区域、2个跨膜区域、11个潜在抗原表位,为可溶性和分泌型蛋白,具有免疫原性,可据此制备多克隆抗体.
為瞭應用生物信息學分析綿羊FGF5基因編碼蛋白的結構與抗原錶位,預測該蛋白的免疫原性.根據牛的FGF5基因cDNA保守區序列設計引物對綿羊FGF5基因cDNA進行擴增,將擴增片段進行剋隆和測序,併與牛的FG F5基因序列進行同源性比較,確定擴增的片段為綿羊FGF5基因片段.利用蛋白分析專傢繫統(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、Motif Scan、SWISS-MODEL等生物信息學在線分析程序,結閤TMH-MM2.0、SignalP3.0、TargetP l.1和PSORTⅡprediction、Gene Runner和DNAMAN等生物信息學軟件,分析、預測FGF5蛋白的理化性質、可溶性、翻譯後脩飾位點、親(疏)水性、跨膜區、信號肽序列、蛋白細胞定位區域、二級結構、抗原錶位等.結果顯示該蛋白由270箇氨基痠組成,分子式C1315 H2085 N389 O378 S6,分子質量單位為29.5847 ku,理論等電點為10.59,波長280 nm時的吸光度(A)值為0.864,半衰期為30 h,22箇翻譯後脩飾位點、多箇親水性高的區域、2箇跨膜區域、11箇潛在抗原錶位,為可溶性和分泌型蛋白,具有免疫原性,可據此製備多剋隆抗體.
위료응용생물신식학분석면양FGF5기인편마단백적결구여항원표위,예측해단백적면역원성.근거우적FGF5기인cDNA보수구서렬설계인물대면양FGF5기인cDNA진행확증,장확증편단진행극륭화측서,병여우적FG F5기인서렬진행동원성비교,학정확증적편단위면양FGF5기인편단.이용단백분석전가계통(ExPASy)제공적ProtParam、SOSUI、Motif Scan、SWISS-MODEL등생물신식학재선분석정서,결합TMH-MM2.0、SignalP3.0、TargetP l.1화PSORTⅡprediction、Gene Runner화DNAMAN등생물신식학연건,분석、예측FGF5단백적이화성질、가용성、번역후수식위점、친(소)수성、과막구、신호태서렬、단백세포정위구역、이급결구、항원표위등.결과현시해단백유270개안기산조성,분자식C1315 H2085 N389 O378 S6,분자질량단위위29.5847 ku,이론등전점위10.59,파장280 nm시적흡광도(A)치위0.864,반쇠기위30 h,22개번역후수식위점、다개친수성고적구역、2개과막구역、11개잠재항원표위,위가용성화분비형단백,구유면역원성,가거차제비다극륭항체.
