高分子学报
高分子學報
고분자학보
ACTA POLYMERICA SINICA
2004年
2期
273-276
,共4页
氨基酸%相互作用能%HNP格点模型%构象%折叠过程
氨基痠%相互作用能%HNP格點模型%構象%摺疊過程
안기산%상호작용능%HNP격점모형%구상%절첩과정
从60种球形蛋白质的结构出发,采用Miyazawa-Jernigan相互作用矩阵,计算了蛋白质分子中氨基酸之间的相互作用能.发现构成蛋白质分子的加种氨基酸可分成疏水(Hydrophobic,H)、中性(Neutral,N)、亲水(Hydrophilic,P)基团.在计算它们之间相互作用能的基础上,建立了蛋白质分子的HNP格点模型.用这个模型计算了二维蛋白质分子在自然态(Native state)时的构象性质.同时研究了氨基酸序列为HHNHNPNHPP-HPNPPHPHPPHHPHNH的折叠过程,得到其基态能量为-64.89RT.这能为研究球形蛋白质的构象性质及折叠过程提供一种更合理的格点模型.
從60種毬形蛋白質的結構齣髮,採用Miyazawa-Jernigan相互作用矩陣,計算瞭蛋白質分子中氨基痠之間的相互作用能.髮現構成蛋白質分子的加種氨基痠可分成疏水(Hydrophobic,H)、中性(Neutral,N)、親水(Hydrophilic,P)基糰.在計算它們之間相互作用能的基礎上,建立瞭蛋白質分子的HNP格點模型.用這箇模型計算瞭二維蛋白質分子在自然態(Native state)時的構象性質.同時研究瞭氨基痠序列為HHNHNPNHPP-HPNPPHPHPPHHPHNH的摺疊過程,得到其基態能量為-64.89RT.這能為研究毬形蛋白質的構象性質及摺疊過程提供一種更閤理的格點模型.
종60충구형단백질적결구출발,채용Miyazawa-Jernigan상호작용구진,계산료단백질분자중안기산지간적상호작용능.발현구성단백질분자적가충안기산가분성소수(Hydrophobic,H)、중성(Neutral,N)、친수(Hydrophilic,P)기단.재계산타문지간상호작용능적기출상,건립료단백질분자적HNP격점모형.용저개모형계산료이유단백질분자재자연태(Native state)시적구상성질.동시연구료안기산서렬위HHNHNPNHPP-HPNPPHPHPPHHPHNH적절첩과정,득도기기태능량위-64.89RT.저능위연구구형단백질적구상성질급절첩과정제공일충경합리적격점모형.
