激光生物学报
激光生物學報
격광생물학보
ACTA LASER BIOLOGY SINICA
2010年
4期
458-465
,共8页
卢韫%张际峰%卢诗瑶%陈文明
盧韞%張際峰%盧詩瑤%陳文明
로운%장제봉%로시요%진문명
大黄鱼%16S rRNA基因%18S rRNA基因%序列分析
大黃魚%16S rRNA基因%18S rRNA基因%序列分析
대황어%16S rRNA기인%18S rRNA기인%서렬분석
利用多对引物,扩增并测定出大黄鱼16S rRNA基因和18S rRNA基因的部分序列,其长度分别为1 202 bp和1 275 bp,16S rRNA基因序列的GC含量为46.12%,18S rRNA基因的GC含量为53.00%.将大黄鱼16S rRNA基因序列与GenBank中15种硬骨鱼类的同源序列结合,同时将其18S rRNA基因序列与GenBank中9种脊索动物的同源序列相结合,运用软件获得各自序列间差异百分比,转换和颠换数值等信息.基于这两种基因序列,利用NJ法和BI法,分别构建16种硬骨鱼类和10种脊索动物的分子系统树.18S rRNA构建的系统树包括三大支,一支为哺乳类、鸟类和爬行类共6个物种,一支为两栖类的1个物种,另一支为2种硬骨鱼类.165 rRNA构建的系统树显示大黄鱼所在的石首鱼科与鲈科和盖刺鱼科亲缘关系较近.此外还讨论了这两个基因的序列特征.
利用多對引物,擴增併測定齣大黃魚16S rRNA基因和18S rRNA基因的部分序列,其長度分彆為1 202 bp和1 275 bp,16S rRNA基因序列的GC含量為46.12%,18S rRNA基因的GC含量為53.00%.將大黃魚16S rRNA基因序列與GenBank中15種硬骨魚類的同源序列結閤,同時將其18S rRNA基因序列與GenBank中9種脊索動物的同源序列相結閤,運用軟件穫得各自序列間差異百分比,轉換和顛換數值等信息.基于這兩種基因序列,利用NJ法和BI法,分彆構建16種硬骨魚類和10種脊索動物的分子繫統樹.18S rRNA構建的繫統樹包括三大支,一支為哺乳類、鳥類和爬行類共6箇物種,一支為兩棲類的1箇物種,另一支為2種硬骨魚類.165 rRNA構建的繫統樹顯示大黃魚所在的石首魚科與鱸科和蓋刺魚科親緣關繫較近.此外還討論瞭這兩箇基因的序列特徵.
이용다대인물,확증병측정출대황어16S rRNA기인화18S rRNA기인적부분서렬,기장도분별위1 202 bp화1 275 bp,16S rRNA기인서렬적GC함량위46.12%,18S rRNA기인적GC함량위53.00%.장대황어16S rRNA기인서렬여GenBank중15충경골어류적동원서렬결합,동시장기18S rRNA기인서렬여GenBank중9충척색동물적동원서렬상결합,운용연건획득각자서렬간차이백분비,전환화전환수치등신식.기우저량충기인서렬,이용NJ법화BI법,분별구건16충경골어류화10충척색동물적분자계통수.18S rRNA구건적계통수포괄삼대지,일지위포유류、조류화파행류공6개물충,일지위량서류적1개물충,령일지위2충경골어류.165 rRNA구건적계통수현시대황어소재적석수어과여로과화개자어과친연관계교근.차외환토론료저량개기인적서렬특정.