中国肿瘤生物治疗杂志
中國腫瘤生物治療雜誌
중국종류생물치료잡지
CHINESE JOURNAL OF CANCER BIOTHERAPY
2009年
3期
227-231
,共5页
陈明水%陈强%李洁羽%周智锋%陈淑萍%叶韵斌
陳明水%陳彊%李潔羽%週智鋒%陳淑萍%葉韻斌
진명수%진강%리길우%주지봉%진숙평%협운빈
survivin%CTL表位%T2细胞%生物信息方法
survivin%CTL錶位%T2細胞%生物信息方法
survivin%CTL표위%T2세포%생물신식방법
目的:采用生物信息方法预测和鉴定survivin抗原HLA-A2+限制性CTL表位,为探索基于survivin的肿瘤免疫治疗奠定基础.方法:采用超基序法和量化基序法对靶抗原survivin HLA-A2+限制性 CTL表位进行预测;选取得分>10的表位肽为候选对象,并进行人工合成.采用T2细胞,以HLA-A2结合实验和流式细胞术(FITC染色)检测候选CTL表位肽的结合亲和力[以荧光系数(fluorescence index,FI)表示];以HLA-A2解离实验和流式细胞术检测其结合稳定性[以复合物解离50%的时间DC50(dissociation complex 50%)表示].结果:预测到的候选survivin CTL表位肽分别是:20STFKNWPFL28 (SV20-28)、23KNWPFLEGC31 (SV23-31)、96LTLGEFLKL104 (SV96-104)、6LPPAWQPFL14 (SV6-14)、33CTPERMAEA41 (SV33-41)、46CPTENEPDL54 (SV46-54)、130KVRRAIEQL138 (SV130-138)、37RMAEAGFIH45 (SV37-45)、88SVKKQFEEL96 (SV88-96).亲和力分析显示:SV20-28 、SV96-104、SV130-138、SV23-31的FI分别为8.61、6.88、5.89、3.81;SV33-41、SV6-14、 SV46-54、 SV37-45 、SV88-96的FI分别为0.31、-0.29、-0.4、-0.16和-0.03;稳定性分析结果DC50为:SV20-28、SV96-104、SV130-138 ＞8 h;SV23-31 为4～6 h;SV6-14、SV33-41、SV88-96为2～4 h;SV46-54、 SV37-45为0～2 h.结果提示,SV20-28 、 SV96-104、SV130-138为高亲和力表位肽,SV23-31为中等亲和力表位肽,SV33-41、SV6-14、 SV46-54、 SV37-45 、SV88-96为低亲和力表位肽.结论:超基序法、量化基序法可快速有效地预测抗原表位,SV20-28 、SV96-104、SV130-138有可能是survivin HLA-A2+ CTL表位,可用于后续研究.
目的:採用生物信息方法預測和鑒定survivin抗原HLA-A2+限製性CTL錶位,為探索基于survivin的腫瘤免疫治療奠定基礎.方法:採用超基序法和量化基序法對靶抗原survivin HLA-A2+限製性 CTL錶位進行預測;選取得分>10的錶位肽為候選對象,併進行人工閤成.採用T2細胞,以HLA-A2結閤實驗和流式細胞術(FITC染色)檢測候選CTL錶位肽的結閤親和力[以熒光繫數(fluorescence index,FI)錶示];以HLA-A2解離實驗和流式細胞術檢測其結閤穩定性[以複閤物解離50%的時間DC50(dissociation complex 50%)錶示].結果:預測到的候選survivin CTL錶位肽分彆是:20STFKNWPFL28 (SV20-28)、23KNWPFLEGC31 (SV23-31)、96LTLGEFLKL104 (SV96-104)、6LPPAWQPFL14 (SV6-14)、33CTPERMAEA41 (SV33-41)、46CPTENEPDL54 (SV46-54)、130KVRRAIEQL138 (SV130-138)、37RMAEAGFIH45 (SV37-45)、88SVKKQFEEL96 (SV88-96).親和力分析顯示:SV20-28 、SV96-104、SV130-138、SV23-31的FI分彆為8.61、6.88、5.89、3.81;SV33-41、SV6-14、 SV46-54、 SV37-45 、SV88-96的FI分彆為0.31、-0.29、-0.4、-0.16和-0.03;穩定性分析結果DC50為:SV20-28、SV96-104、SV130-138 ＞8 h;SV23-31 為4～6 h;SV6-14、SV33-41、SV88-96為2～4 h;SV46-54、 SV37-45為0～2 h.結果提示,SV20-28 、 SV96-104、SV130-138為高親和力錶位肽,SV23-31為中等親和力錶位肽,SV33-41、SV6-14、 SV46-54、 SV37-45 、SV88-96為低親和力錶位肽.結論:超基序法、量化基序法可快速有效地預測抗原錶位,SV20-28 、SV96-104、SV130-138有可能是survivin HLA-A2+ CTL錶位,可用于後續研究.
목적:채용생물신식방법예측화감정survivin항원HLA-A2+한제성CTL표위,위탐색기우survivin적종류면역치료전정기출.방법:채용초기서법화양화기서법대파항원survivin HLA-A2+한제성 CTL표위진행예측;선취득분>10적표위태위후선대상,병진행인공합성.채용T2세포,이HLA-A2결합실험화류식세포술(FITC염색)검측후선CTL표위태적결합친화력[이형광계수(fluorescence index,FI)표시];이HLA-A2해리실험화류식세포술검측기결합은정성[이복합물해리50%적시간DC50(dissociation complex 50%)표시].결과:예측도적후선survivin CTL표위태분별시:20STFKNWPFL28 (SV20-28)、23KNWPFLEGC31 (SV23-31)、96LTLGEFLKL104 (SV96-104)、6LPPAWQPFL14 (SV6-14)、33CTPERMAEA41 (SV33-41)、46CPTENEPDL54 (SV46-54)、130KVRRAIEQL138 (SV130-138)、37RMAEAGFIH45 (SV37-45)、88SVKKQFEEL96 (SV88-96).친화력분석현시:SV20-28 、SV96-104、SV130-138、SV23-31적FI분별위8.61、6.88、5.89、3.81;SV33-41、SV6-14、 SV46-54、 SV37-45 、SV88-96적FI분별위0.31、-0.29、-0.4、-0.16화-0.03;은정성분석결과DC50위:SV20-28、SV96-104、SV130-138 ＞8 h;SV23-31 위4～6 h;SV6-14、SV33-41、SV88-96위2～4 h;SV46-54、 SV37-45위0～2 h.결과제시,SV20-28 、 SV96-104、SV130-138위고친화력표위태,SV23-31위중등친화력표위태,SV33-41、SV6-14、 SV46-54、 SV37-45 、SV88-96위저친화력표위태.결론:초기서법、양화기서법가쾌속유효지예측항원표위,SV20-28 、SV96-104、SV130-138유가능시survivin HLA-A2+ CTL표위,가용우후속연구.
