安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
28期
17168-17171,17175
,共5页
焦春香%张奉波%夏金兰%张成桂
焦春香%張奉波%夏金蘭%張成桂
초춘향%장봉파%하금란%장성계
隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5%分泌蛋白质组%信号肽
隱藏嗜痠菌Acidiphilium cryptumJF-5%分泌蛋白質組%信號肽
은장기산균Acidiphilium cryptumJF-5%분비단백질조%신호태
[目的]对隐藏嗜酸菌(Acdiphiliumc cryptum JF-5)全基因组的3 063个氨基酸序列进行预测,分析其分泌蛋白质组的构成.[方法]利用信号肽预测软件SignalP v3.0、跨膜螺旋结构预测软件TMHMM v2.0 、RR-motif信号肽预测软件TatP v1.0、脂蛋白质信号肽预测软件LipoP v1.0、非经典分泌蛋白质预测软件SecretomeP和亚细胞定位软件Psortb v2.0.4对Acidiphilium cryptum JF-5全基因组的3 063个氨基酸序列进行预测分析.[结果]在隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptum JF-5中有444个蛋白质为分泌蛋白质,其中分泌型信号肽148个,RR-motif亚组型信号肽27个,脂蛋白质信号肽22个,无Prepiplin-like信号肽,非经典分泌蛋白质247个；另外,对分泌型信号肽的长度分布、氨基酸使用频率和酶切位点的氨基酸使用频率作出了统计分析.[结论]研究结果为进一步研究嗜酸菌Acidiphiliumc cryptumJF-5的基因功能提供了丰富的信息基础.
[目的]對隱藏嗜痠菌(Acdiphiliumc cryptum JF-5)全基因組的3 063箇氨基痠序列進行預測,分析其分泌蛋白質組的構成.[方法]利用信號肽預測軟件SignalP v3.0、跨膜螺鏇結構預測軟件TMHMM v2.0 、RR-motif信號肽預測軟件TatP v1.0、脂蛋白質信號肽預測軟件LipoP v1.0、非經典分泌蛋白質預測軟件SecretomeP和亞細胞定位軟件Psortb v2.0.4對Acidiphilium cryptum JF-5全基因組的3 063箇氨基痠序列進行預測分析.[結果]在隱藏嗜痠菌Acidiphilium cryptum JF-5中有444箇蛋白質為分泌蛋白質,其中分泌型信號肽148箇,RR-motif亞組型信號肽27箇,脂蛋白質信號肽22箇,無Prepiplin-like信號肽,非經典分泌蛋白質247箇；另外,對分泌型信號肽的長度分佈、氨基痠使用頻率和酶切位點的氨基痠使用頻率作齣瞭統計分析.[結論]研究結果為進一步研究嗜痠菌Acidiphiliumc cryptumJF-5的基因功能提供瞭豐富的信息基礎.
[목적]대은장기산균(Acdiphiliumc cryptum JF-5)전기인조적3 063개안기산서렬진행예측,분석기분비단백질조적구성.[방법]이용신호태예측연건SignalP v3.0、과막라선결구예측연건TMHMM v2.0 、RR-motif신호태예측연건TatP v1.0、지단백질신호태예측연건LipoP v1.0、비경전분비단백질예측연건SecretomeP화아세포정위연건Psortb v2.0.4대Acidiphilium cryptum JF-5전기인조적3 063개안기산서렬진행예측분석.[결과]재은장기산균Acidiphilium cryptum JF-5중유444개단백질위분비단백질,기중분비형신호태148개,RR-motif아조형신호태27개,지단백질신호태22개,무Prepiplin-like신호태,비경전분비단백질247개；령외,대분비형신호태적장도분포、안기산사용빈솔화매절위점적안기산사용빈솔작출료통계분석.[결론]연구결과위진일보연구기산균Acidiphiliumc cryptumJF-5적기인공능제공료봉부적신식기출.
