大连海洋大学学报
大連海洋大學學報
대련해양대학학보
JOURNAL OF DALIAN FISHERIES UNIVERSITY
2011年
5期
452-457
,共6页
郑将臣%万全%程起群%赵金良
鄭將臣%萬全%程起群%趙金良
정장신%만전%정기군%조금량
龟鳖类%R35基因%RAG2基因%遗传趋异%分子分类%系统进化
龜鱉類%R35基因%RAG2基因%遺傳趨異%分子分類%繫統進化
구별류%R35기인%RAG2기인%유전추이%분자분류%계통진화
为从核基因的角度探讨龟鳖类的系统发育特征,采用PCR扩增和测序的方法,获得两种龟的R35内含子部分序列以及6种龟的RAG2基因部分序列,结合NCBI其它龟鳖的同源序列一并进行分析.结果表明:将R35序列比对后得到941 bp的一致序列,将RAG2比对后得到620 bp的一致序列,二者合并后,比对排序后得到1561 bp的一致序列,其中共有505个可变核苷酸位点,总变异率为32.35%;简约信息位点为239个,插入/缺失为139个,转换/颠换比率为1.64.碱基A、T、G、C的平均含量分别为29.5%、28.5%、22.8%、19.2%.海龟科和鳄龟科之间Kimura双参数(K-2-P)遗传距离最小(0.025),鳖科和南美侧颈龟科之间的遗传距离最大(0.182).分子系统树结果显示:1)陆龟科与潮龟科先聚在一起,再与龟科聚在一起,陆龟科与潮龟科构成一个单系类群;2)支持陆龟总科与鳄龟科+海龟总科构成姐妹群;3)鳄龟科和海龟总科是姐妹群的关系.
為從覈基因的角度探討龜鱉類的繫統髮育特徵,採用PCR擴增和測序的方法,穫得兩種龜的R35內含子部分序列以及6種龜的RAG2基因部分序列,結閤NCBI其它龜鱉的同源序列一併進行分析.結果錶明:將R35序列比對後得到941 bp的一緻序列,將RAG2比對後得到620 bp的一緻序列,二者閤併後,比對排序後得到1561 bp的一緻序列,其中共有505箇可變覈苷痠位點,總變異率為32.35%;簡約信息位點為239箇,插入/缺失為139箇,轉換/顛換比率為1.64.堿基A、T、G、C的平均含量分彆為29.5%、28.5%、22.8%、19.2%.海龜科和鱷龜科之間Kimura雙參數(K-2-P)遺傳距離最小(0.025),鱉科和南美側頸龜科之間的遺傳距離最大(0.182).分子繫統樹結果顯示:1)陸龜科與潮龜科先聚在一起,再與龜科聚在一起,陸龜科與潮龜科構成一箇單繫類群;2)支持陸龜總科與鱷龜科+海龜總科構成姐妹群;3)鱷龜科和海龜總科是姐妹群的關繫.
위종핵기인적각도탐토구별류적계통발육특정,채용PCR확증화측서적방법,획득량충구적R35내함자부분서렬이급6충구적RAG2기인부분서렬,결합NCBI기타구별적동원서렬일병진행분석.결과표명:장R35서렬비대후득도941 bp적일치서렬,장RAG2비대후득도620 bp적일치서렬,이자합병후,비대배서후득도1561 bp적일치서렬,기중공유505개가변핵감산위점,총변이솔위32.35%;간약신식위점위239개,삽입/결실위139개,전환/전환비솔위1.64.감기A、T、G、C적평균함량분별위29.5%、28.5%、22.8%、19.2%.해구과화악구과지간Kimura쌍삼수(K-2-P)유전거리최소(0.025),별과화남미측경구과지간적유전거리최대(0.182).분자계통수결과현시:1)륙구과여조구과선취재일기,재여구과취재일기,륙구과여조구과구성일개단계류군;2)지지륙구총과여악구과+해구총과구성저매군;3)악구과화해구총과시저매군적관계.