生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2009年
3期
202-206,211
,共6页
KRAB功能域%锌指基因%亚家族%进化
KRAB功能域%鋅指基因%亞傢族%進化
KRAB공능역%자지기인%아가족%진화
KRAB锌指基因是哺乳动物中最大的转录调控因子家族, 它的多数成员在基因组上成簇分布,具有五种不同的亚家族,在功能行使上承担着不同的作用.本文通过对人类、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗五种哺乳动物全蛋白质组序列及mRNA组织表达谱分析,验证了C2H2锌指结构在单个KRAB蛋白质中出现的数目多于一般锌指蛋白质;KRAB功能域在各物种中分布显著不同且与分化时间不成正比,这表明KRAB相关功能域多样性在灵长类进化过程中潜在的适应性进化.同时,提出KRAB亚家族进化的路线:即KRAB-Aa为起始家族,Ba由Aa直接演变形成,而Ca,blonga和XRCC三种亚型可能经过Ba或直接从Aa演变形成;此外,锌指结构在单个蛋白质中出现个数伴随KRAB功能域自身的进化路线逐渐递增,反映了KRAB功能域在形成新转录调控因子方面的积极作用.
KRAB鋅指基因是哺乳動物中最大的轉錄調控因子傢族, 它的多數成員在基因組上成簇分佈,具有五種不同的亞傢族,在功能行使上承擔著不同的作用.本文通過對人類、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗五種哺乳動物全蛋白質組序列及mRNA組織錶達譜分析,驗證瞭C2H2鋅指結構在單箇KRAB蛋白質中齣現的數目多于一般鋅指蛋白質;KRAB功能域在各物種中分佈顯著不同且與分化時間不成正比,這錶明KRAB相關功能域多樣性在靈長類進化過程中潛在的適應性進化.同時,提齣KRAB亞傢族進化的路線:即KRAB-Aa為起始傢族,Ba由Aa直接縯變形成,而Ca,blonga和XRCC三種亞型可能經過Ba或直接從Aa縯變形成;此外,鋅指結構在單箇蛋白質中齣現箇數伴隨KRAB功能域自身的進化路線逐漸遞增,反映瞭KRAB功能域在形成新轉錄調控因子方麵的積極作用.
KRAB자지기인시포유동물중최대적전록조공인자가족, 타적다수성원재기인조상성족분포,구유오충불동적아가족,재공능행사상승담착불동적작용.본문통과대인류、흑성성、소서、대서화구오충포유동물전단백질조서렬급mRNA조직표체보분석,험증료C2H2자지결구재단개KRAB단백질중출현적수목다우일반자지단백질;KRAB공능역재각물충중분포현저불동차여분화시간불성정비,저표명KRAB상관공능역다양성재령장류진화과정중잠재적괄응성진화.동시,제출KRAB아가족진화적로선:즉KRAB-Aa위기시가족,Ba유Aa직접연변형성,이Ca,blonga화XRCC삼충아형가능경과Ba혹직접종Aa연변형성;차외,자지결구재단개단백질중출현개수반수KRAB공능역자신적진화로선축점체증,반영료KRAB공능역재형성신전록조공인자방면적적겁작용.
