病毒学报
病毒學報
병독학보
CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY
2005年
3期
217-222
,共6页
李琳琳%何雅晴%朱俊萍%薛颖%朱雅芳%徐星晔%金奇
李琳琳%何雅晴%硃俊萍%薛穎%硃雅芳%徐星曄%金奇
리림림%하아청%주준평%설영%주아방%서성엽%금기
柯萨奇病毒%基因组%手足口病%同源性分析
柯薩奇病毒%基因組%手足口病%同源性分析
가살기병독%기인조%수족구병%동원성분석
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16 SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7 410bp,其中5'端非编码区(5'UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6 582个核苷酸,编码一个含2 193个氨基酸残基的多聚蛋白,3'端非编码区长为83bp.Cox.A16 SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%.Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%.
對分離自2000年中國深圳地區手足口病患兒糞便標本的柯薩奇病毒A組16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株進行全基因組序列測定及分析後髮現,Cox.A16 SHZH00-1的基因組(未包括多聚腺苷痠尾)長度為7 410bp,其中5'耑非編碼區(5'UTR)長為745bp,病毒基因組編碼區全長6 582箇覈苷痠,編碼一箇含2 193箇氨基痠殘基的多聚蛋白,3'耑非編碼區長為83bp.Cox.A16 SHZH00-1基因組的結構與Cox.A16亞洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整箇基因組的覈苷痠同源性為97.5%,氨基痠同源性為98.8%;而與Cox.A16國際標準株G10(U05876)差彆較大,兩者覈苷痠同源性僅為79.1%,氨基痠同源性為94.5%.Cox.A16SHZH00-1與兩株腸道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比較,覈苷痠同源性均不超過80%.
대분리자2000년중국심수지구수족구병환인분편표본적가살기병독A조16형(Coxsackievirus A16,Cox.A16)병독SHZH00-1주진행전기인조서렬측정급분석후발현,Cox.A16 SHZH00-1적기인조(미포괄다취선감산미)장도위7 410bp,기중5'단비편마구(5'UTR)장위745bp,병독기인조편마구전장6 582개핵감산,편마일개함2 193개안기산잔기적다취단백,3'단비편마구장위83bp.Cox.A16 SHZH00-1기인조적결구여Cox.A16아주지방주Tainan-5079-98(AF177911)십분상근,정개기인조적핵감산동원성위97.5%,안기산동원성위98.8%;이여Cox.A16국제표준주G10(U05876)차별교대,량자핵감산동원성부위79.1%,안기산동원성위94.5%.Cox.A16SHZH00-1여량주장도병독71형SHZH03(AY465356)화BrCr(U22521)비교,핵감산동원성균불초과80%.
