复旦学报(医学版)
複旦學報(醫學版)
복단학보(의학판)
FUDAN UNIVERSITY JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES
2005年
2期
169-172
,共4页
乳腺癌%基因芯片%聚类分析%COX回归模型
乳腺癌%基因芯片%聚類分析%COX迴歸模型
유선암%기인심편%취류분석%COX회귀모형
目的以乳腺癌病人的表达谱芯片数据为基础,探寻乳腺癌复发的相关基因.方法对标化芯片数据进行缺失值处理后,分别用单因素COX回归模型和综合了聚类及多因素COX回归的综合法来筛选兴趣基因,然后通过兴趣基因对病人做样品聚类,以灵敏度、特异度、约登指数和Kaplan-Meier法评价分类效果,最后结合文献和蛋白质数据库探寻乳腺癌复发的相关基因.结果综合法筛出的30个P<0.01的基因对乳腺癌病人复发状况的预测效果最佳;单因素COX回归筛出的102个P<0.01的基因的预测效果较差;单因素COX回归筛出的15个P<0.001的基因预测效果最差.结论综合法筛选得到的30个基因可用来评价病人的预后状况,为进一步的生物学研究提供待选基因.
目的以乳腺癌病人的錶達譜芯片數據為基礎,探尋乳腺癌複髮的相關基因.方法對標化芯片數據進行缺失值處理後,分彆用單因素COX迴歸模型和綜閤瞭聚類及多因素COX迴歸的綜閤法來篩選興趣基因,然後通過興趣基因對病人做樣品聚類,以靈敏度、特異度、約登指數和Kaplan-Meier法評價分類效果,最後結閤文獻和蛋白質數據庫探尋乳腺癌複髮的相關基因.結果綜閤法篩齣的30箇P<0.01的基因對乳腺癌病人複髮狀況的預測效果最佳;單因素COX迴歸篩齣的102箇P<0.01的基因的預測效果較差;單因素COX迴歸篩齣的15箇P<0.001的基因預測效果最差.結論綜閤法篩選得到的30箇基因可用來評價病人的預後狀況,為進一步的生物學研究提供待選基因.
목적이유선암병인적표체보심편수거위기출,탐심유선암복발적상관기인.방법대표화심편수거진행결실치처리후,분별용단인소COX회귀모형화종합료취류급다인소COX회귀적종합법래사선흥취기인,연후통과흥취기인대병인주양품취류,이령민도、특이도、약등지수화Kaplan-Meier법평개분류효과,최후결합문헌화단백질수거고탐심유선암복발적상관기인.결과종합법사출적30개P<0.01적기인대유선암병인복발상황적예측효과최가;단인소COX회귀사출적102개P<0.01적기인적예측효과교차;단인소COX회귀사출적15개P<0.001적기인예측효과최차.결론종합법사선득도적30개기인가용래평개병인적예후상황,위진일보적생물학연구제공대선기인.