中国病原生物学杂志
中國病原生物學雜誌
중국병원생물학잡지
JOURNAL OF PATHOGEN BIOLOGY
2008年
2期
110-113
,共4页
林睿%黎学铭%胡缨%牛安欧%胡文庆
林睿%黎學銘%鬍纓%牛安歐%鬍文慶
림예%려학명%호영%우안구%호문경
钉螺%Cytb基因%遗传多态性%系统进化
釘螺%Cytb基因%遺傳多態性%繫統進化
정라%Cytb기인%유전다태성%계통진화
目的 分析广西钉螺与云南、湖南钉螺Cytb基因的遗传多态性和系统进化关系.方法 收集广西靖西、云南洱源和湖南岳阳三地钉螺,提取其基因组DNA, PCR法扩增线粒体Cytb基因并测序.用Clustal W(1.82)软件对所测得的Cytb基因序列进行排序,用MEGA3.1计算其碱基组成、转换及颠换;用Kimura双参数法计算遗传距离,用非加权组平均法(UPGMA)和最大简约法(MP)构建系统发生树,同时结合三地钉螺分布和孳生地等资料进行分析.结果 PCR扩增获得Cytb基因大小为580bp.三地钉螺Cytb基因序列富含碱基A和T,A+T平均含量为61.2%,表现出较强的碱基组成偏倚.三地钉螺Cytb基因578bp的同源序列中检测到165个变异位点,约占核苷酸总数的28.5%.其中广西钉螺与湖南钉螺Cytb基因序列的变异位点为17个,约占2.94%;广西钉螺与云南钉螺Cytb基因序列的变异位点为160个,约占27.7%.广西钉螺与湖南、云南钉螺Cytb基因的遗传距离分别为0.031、0.405.采用两种方法构建的系统进化树均显示广西钉螺与湖南钉螺同属一个支系,云南钉螺单独形成另一支系.结论 广西钉螺与云南钉螺存在较大基因差异,进化速率较大,保守性较小,遗传距离较大,亲缘关系较远;广西钉螺与湖南钉螺基因差异较小,相对保守,进化速率不太大,遗传距离较小,亲缘关系较近.
目的 分析廣西釘螺與雲南、湖南釘螺Cytb基因的遺傳多態性和繫統進化關繫.方法 收集廣西靖西、雲南洱源和湖南嶽暘三地釘螺,提取其基因組DNA, PCR法擴增線粒體Cytb基因併測序.用Clustal W(1.82)軟件對所測得的Cytb基因序列進行排序,用MEGA3.1計算其堿基組成、轉換及顛換;用Kimura雙參數法計算遺傳距離,用非加權組平均法(UPGMA)和最大簡約法(MP)構建繫統髮生樹,同時結閤三地釘螺分佈和孳生地等資料進行分析.結果 PCR擴增穫得Cytb基因大小為580bp.三地釘螺Cytb基因序列富含堿基A和T,A+T平均含量為61.2%,錶現齣較彊的堿基組成偏倚.三地釘螺Cytb基因578bp的同源序列中檢測到165箇變異位點,約佔覈苷痠總數的28.5%.其中廣西釘螺與湖南釘螺Cytb基因序列的變異位點為17箇,約佔2.94%;廣西釘螺與雲南釘螺Cytb基因序列的變異位點為160箇,約佔27.7%.廣西釘螺與湖南、雲南釘螺Cytb基因的遺傳距離分彆為0.031、0.405.採用兩種方法構建的繫統進化樹均顯示廣西釘螺與湖南釘螺同屬一箇支繫,雲南釘螺單獨形成另一支繫.結論 廣西釘螺與雲南釘螺存在較大基因差異,進化速率較大,保守性較小,遺傳距離較大,親緣關繫較遠;廣西釘螺與湖南釘螺基因差異較小,相對保守,進化速率不太大,遺傳距離較小,親緣關繫較近.
목적 분석엄서정라여운남、호남정라Cytb기인적유전다태성화계통진화관계.방법 수집엄서정서、운남이원화호남악양삼지정라,제취기기인조DNA, PCR법확증선립체Cytb기인병측서.용Clustal W(1.82)연건대소측득적Cytb기인서렬진행배서,용MEGA3.1계산기감기조성、전환급전환;용Kimura쌍삼수법계산유전거리,용비가권조평균법(UPGMA)화최대간약법(MP)구건계통발생수,동시결합삼지정라분포화자생지등자료진행분석.결과 PCR확증획득Cytb기인대소위580bp.삼지정라Cytb기인서렬부함감기A화T,A+T평균함량위61.2%,표현출교강적감기조성편의.삼지정라Cytb기인578bp적동원서렬중검측도165개변이위점,약점핵감산총수적28.5%.기중엄서정라여호남정라Cytb기인서렬적변이위점위17개,약점2.94%;엄서정라여운남정라Cytb기인서렬적변이위점위160개,약점27.7%.엄서정라여호남、운남정라Cytb기인적유전거리분별위0.031、0.405.채용량충방법구건적계통진화수균현시엄서정라여호남정라동속일개지계,운남정라단독형성령일지계.결론 엄서정라여운남정라존재교대기인차이,진화속솔교대,보수성교소,유전거리교대,친연관계교원;엄서정라여호남정라기인차이교소,상대보수,진화속솔불태대,유전거리교소,친연관계교근.