计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2011年
1期
83-87
,共5页
改进基因表达式编程%整合酶抑制剂%定量结构活性关系
改進基因錶達式編程%整閤酶抑製劑%定量結構活性關繫
개진기인표체식편정%정합매억제제%정량결구활성관계
提出1种混合使用模拟退火和竞赛规则选择算子的改进GEP算法-GEPMS 算法.以E-Dragon软件计算、经RM算法筛选得到的7个RDF描述符作为自变量,以抗HIV-1活性IC50值作为因变量,基于 GEPMS 算法建立关于48种喹诺酮羧酸类化合物的HIV-1整合酶抑制剂活性的QSAR模型.与GEP、GEPSA和v-SVM算法建立的QSAR模型进行比较,本文模型、GEP、GEPSA和v-SVM模型对训练集的计算结果,决定系数R2分别为0.9667、0.9624、0.9348和0.9711,对验证集的预测结果R2则分别为0.9565、0.8974、0.9124和0.7656,表明本文的GEPMS模型具有最佳的泛化能力,算法的改进效果明显.
提齣1種混閤使用模擬退火和競賽規則選擇算子的改進GEP算法-GEPMS 算法.以E-Dragon軟件計算、經RM算法篩選得到的7箇RDF描述符作為自變量,以抗HIV-1活性IC50值作為因變量,基于 GEPMS 算法建立關于48種喹諾酮羧痠類化閤物的HIV-1整閤酶抑製劑活性的QSAR模型.與GEP、GEPSA和v-SVM算法建立的QSAR模型進行比較,本文模型、GEP、GEPSA和v-SVM模型對訓練集的計算結果,決定繫數R2分彆為0.9667、0.9624、0.9348和0.9711,對驗證集的預測結果R2則分彆為0.9565、0.8974、0.9124和0.7656,錶明本文的GEPMS模型具有最佳的汎化能力,算法的改進效果明顯.
제출1충혼합사용모의퇴화화경새규칙선택산자적개진GEP산법-GEPMS 산법.이E-Dragon연건계산、경RM산법사선득도적7개RDF묘술부작위자변량,이항HIV-1활성IC50치작위인변량,기우 GEPMS 산법건립관우48충규낙동최산류화합물적HIV-1정합매억제제활성적QSAR모형.여GEP、GEPSA화v-SVM산법건립적QSAR모형진행비교,본문모형、GEP、GEPSA화v-SVM모형대훈련집적계산결과,결정계수R2분별위0.9667、0.9624、0.9348화0.9711,대험증집적예측결과R2칙분별위0.9565、0.8974、0.9124화0.7656,표명본문적GEPMS모형구유최가적범화능력,산법적개진효과명현.
