水生生物学报
水生生物學報
수생생물학보
ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA
2011年
2期
229-237
,共9页
王中铎%郭昱嵩%刘楚吾%刘筠
王中鐸%郭昱嵩%劉楚吾%劉筠
왕중탁%곽욱숭%류초오%류균
军曹鱼%线粒体DNA%系统进化%鲹鱼宗系
軍曹魚%線粒體DNA%繫統進化%鲹魚宗繫
군조어%선립체DNA%계통진화%소어종계
通过长距PCR法测得军曹鱼(Rachycentron canadum)全长16758 bp的mtDNA基因组全序列(GenBank登录号:FJ154956和NC 011219),结构组成与其他硬骨鱼类基本一致.Blast获取GenBank数据库的高相似度(score=10055-30213)全序列数据,运用最大简约法、邻位连接法、最大似然法和贝叶斯法重建了军曹鱼与其他鱼类的系统发育关系,并采样用松散分子钟(Uncorrected relaxed lognormal clock)对军曹鱼的起源时间进行了估算,结果表明:(1)军曹鱼与鲯鳅科的亲缘关系较参与分析的其他鱼类更为密切(后验概率为0.997),推测军曹鱼大约起源于56百万年(Million years ago,Ma)前的古新世塔内特阶(Thanetian)时期;(2)军曹鱼科、鲯鳅科和印鱼科聚为一支,但其置信度较低(后验概率为0.593),且丝帆鱼科、鲹科分别与鲭科和鲀科鱼类聚为不同分支,因此不支持鲹鱼宗系(Carangoid lineage)为单系群.
通過長距PCR法測得軍曹魚(Rachycentron canadum)全長16758 bp的mtDNA基因組全序列(GenBank登錄號:FJ154956和NC 011219),結構組成與其他硬骨魚類基本一緻.Blast穫取GenBank數據庫的高相似度(score=10055-30213)全序列數據,運用最大簡約法、鄰位連接法、最大似然法和貝葉斯法重建瞭軍曹魚與其他魚類的繫統髮育關繫,併採樣用鬆散分子鐘(Uncorrected relaxed lognormal clock)對軍曹魚的起源時間進行瞭估算,結果錶明:(1)軍曹魚與鲯鰍科的親緣關繫較參與分析的其他魚類更為密切(後驗概率為0.997),推測軍曹魚大約起源于56百萬年(Million years ago,Ma)前的古新世塔內特階(Thanetian)時期;(2)軍曹魚科、鲯鰍科和印魚科聚為一支,但其置信度較低(後驗概率為0.593),且絲帆魚科、鲹科分彆與鯖科和鲀科魚類聚為不同分支,因此不支持鲹魚宗繫(Carangoid lineage)為單繫群.
통과장거PCR법측득군조어(Rachycentron canadum)전장16758 bp적mtDNA기인조전서렬(GenBank등록호:FJ154956화NC 011219),결구조성여기타경골어류기본일치.Blast획취GenBank수거고적고상사도(score=10055-30213)전서렬수거,운용최대간약법、린위련접법、최대사연법화패협사법중건료군조어여기타어류적계통발육관계,병채양용송산분자종(Uncorrected relaxed lognormal clock)대군조어적기원시간진행료고산,결과표명:(1)군조어여기추과적친연관계교삼여분석적기타어류경위밀절(후험개솔위0.997),추측군조어대약기원우56백만년(Million years ago,Ma)전적고신세탑내특계(Thanetian)시기;(2)군조어과、기추과화인어과취위일지,단기치신도교저(후험개솔위0.593),차사범어과、소과분별여청과화돈과어류취위불동분지,인차불지지소어종계(Carangoid lineage)위단계군.
