中国癌症杂志
中國癌癥雜誌
중국암증잡지
CHINA ONCOLOGY
2012年
5期
352-357
,共6页
袁荣发%余新%刘秀霞%王庆诺%蔡红平%邵江华
袁榮髮%餘新%劉秀霞%王慶諾%蔡紅平%邵江華
원영발%여신%류수하%왕경낙%채홍평%소강화
肝细胞癌%单体型%病例对照研究%FAT10基因
肝細胞癌%單體型%病例對照研究%FAT10基因
간세포암%단체형%병례대조연구%FAT10기인
背景与目的:人类白细胞抗原FAT10是类泛素调节子蛋白家族中的一员,被认为与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生、发展密切相关.本研究探讨FAT10基因单体型与肝细胞癌的关系.方法:收集254例肝癌病例和268例健康对照人群外周血标本,提取DNA,通过DNA测序分析方法,检测两组人群FAT10基因外显子和侧翼序列单核苷酸多态性.应用Haploview统计软件分析研究对象的连锁不平衡和单体型,并应用病例对照分析方法进行相关性研究.结果:在肝癌组和对照组FAT10基因外显子和侧翼序列上共检测到10个多态性位点.遗传不平衡发现-143 A/G、-121 A/G、+3446 C/T、+3476 T/C、+3527 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G、+3803 C/G、+3809 G/T 9个SNPs在同一个单体型块,其中-121 A/G、+3476 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G和+3809 G/T多态位点完全连锁.进一步选择-143 A/G、+3476 T/C和+3527T/C 3个tagSNPs进行关联分析和单体型构建,发现-143 A/G和+3476 T/C基因型与相应的野生型纯合子相比能明显降低肝癌发病的风险(P<0.05).进一步单体型分析发现ATT、ATC、GCT和ACT 4种单体型,其中肝癌患者的GCT和ACT单体型频率显著低于对照组(P<0.05),而ATT单体型频率显著高于对照组(P<0.05),经过1×108的随机置换检验校正后,ATT和GCT单体型与肝癌的发病风险仍然显著相关.结论:FAT10基因单体型可能与肝癌的发病风险相关,ATT单体型可能是肝癌的遗传标志.
揹景與目的:人類白細胞抗原FAT10是類汎素調節子蛋白傢族中的一員,被認為與肝細胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)髮生、髮展密切相關.本研究探討FAT10基因單體型與肝細胞癌的關繫.方法:收集254例肝癌病例和268例健康對照人群外週血標本,提取DNA,通過DNA測序分析方法,檢測兩組人群FAT10基因外顯子和側翼序列單覈苷痠多態性.應用Haploview統計軟件分析研究對象的連鎖不平衡和單體型,併應用病例對照分析方法進行相關性研究.結果:在肝癌組和對照組FAT10基因外顯子和側翼序列上共檢測到10箇多態性位點.遺傳不平衡髮現-143 A/G、-121 A/G、+3446 C/T、+3476 T/C、+3527 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G、+3803 C/G、+3809 G/T 9箇SNPs在同一箇單體型塊,其中-121 A/G、+3476 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G和+3809 G/T多態位點完全連鎖.進一步選擇-143 A/G、+3476 T/C和+3527T/C 3箇tagSNPs進行關聯分析和單體型構建,髮現-143 A/G和+3476 T/C基因型與相應的野生型純閤子相比能明顯降低肝癌髮病的風險(P<0.05).進一步單體型分析髮現ATT、ATC、GCT和ACT 4種單體型,其中肝癌患者的GCT和ACT單體型頻率顯著低于對照組(P<0.05),而ATT單體型頻率顯著高于對照組(P<0.05),經過1×108的隨機置換檢驗校正後,ATT和GCT單體型與肝癌的髮病風險仍然顯著相關.結論:FAT10基因單體型可能與肝癌的髮病風險相關,ATT單體型可能是肝癌的遺傳標誌.
배경여목적:인류백세포항원FAT10시류범소조절자단백가족중적일원,피인위여간세포암(hepatocellular carcinoma,HCC)발생、발전밀절상관.본연구탐토FAT10기인단체형여간세포암적관계.방법:수집254례간암병례화268례건강대조인군외주혈표본,제취DNA,통과DNA측서분석방법,검측량조인군FAT10기인외현자화측익서렬단핵감산다태성.응용Haploview통계연건분석연구대상적련쇄불평형화단체형,병응용병례대조분석방법진행상관성연구.결과:재간암조화대조조FAT10기인외현자화측익서렬상공검측도10개다태성위점.유전불평형발현-143 A/G、-121 A/G、+3446 C/T、+3476 T/C、+3527 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G、+3803 C/G、+3809 G/T 9개SNPs재동일개단체형괴,기중-121 A/G、+3476 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G화+3809 G/T다태위점완전련쇄.진일보선택-143 A/G、+3476 T/C화+3527T/C 3개tagSNPs진행관련분석화단체형구건,발현-143 A/G화+3476 T/C기인형여상응적야생형순합자상비능명현강저간암발병적풍험(P<0.05).진일보단체형분석발현ATT、ATC、GCT화ACT 4충단체형,기중간암환자적GCT화ACT단체형빈솔현저저우대조조(P<0.05),이ATT단체형빈솔현저고우대조조(P<0.05),경과1×108적수궤치환검험교정후,ATT화GCT단체형여간암적발병풍험잉연현저상관.결론:FAT10기인단체형가능여간암적발병풍험상관,ATT단체형가능시간암적유전표지.