计算机工程与科学
計算機工程與科學
계산궤공정여과학
COMPUTER ENGINEERING & SCIENCE
2010年
9期
148-151
,共4页
大肠杆菌启动子%位置关联打分函数%多样性指标%修正的马氏判别式
大腸桿菌啟動子%位置關聯打分函數%多樣性指標%脩正的馬氏判彆式
대장간균계동자%위치관련타분함수%다양성지표%수정적마씨판별식
本文对实验证实的741条大肠杆菌Sigma70启动子的序列进行预测研究.首先,基于RNA聚合酶与DNA的相互作用,利用位置打分函数对序列中的保守位点进行了衡量;然后,根据启动子的序列特征,利用离散性指标对序列中不同的碱基信息含量进行测量;最后,利用多元非线性判别分析实现了对大肠杆菌启动子的预测.10折叠交叉检验结果显示,总体预测精度达到85%以上.与其它算法比较结果显示,我们开发的这一算法能够更好地预测大肠杆菌启动子.
本文對實驗證實的741條大腸桿菌Sigma70啟動子的序列進行預測研究.首先,基于RNA聚閤酶與DNA的相互作用,利用位置打分函數對序列中的保守位點進行瞭衡量;然後,根據啟動子的序列特徵,利用離散性指標對序列中不同的堿基信息含量進行測量;最後,利用多元非線性判彆分析實現瞭對大腸桿菌啟動子的預測.10摺疊交扠檢驗結果顯示,總體預測精度達到85%以上.與其它算法比較結果顯示,我們開髮的這一算法能夠更好地預測大腸桿菌啟動子.
본문대실험증실적741조대장간균Sigma70계동자적서렬진행예측연구.수선,기우RNA취합매여DNA적상호작용,이용위치타분함수대서렬중적보수위점진행료형량;연후,근거계동자적서렬특정,이용리산성지표대서렬중불동적감기신식함량진행측량;최후,이용다원비선성판별분석실현료대대장간균계동자적예측.10절첩교차검험결과현시,총체예측정도체도85%이상.여기타산법비교결과현시,아문개발적저일산법능구경호지예측대장간균계동자.
