上海海洋大学学报
上海海洋大學學報
상해해양대학학보
JOURNAL OF SHANGHAI OCEAN UNIVERSITY
2009年
6期
662-666
,共5页
刘豪%王成辉%杨新鑫%王军%马玉清
劉豪%王成輝%楊新鑫%王軍%馬玉清
류호%왕성휘%양신흠%왕군%마옥청
瓯江彩鲤%体色%差异表达基因%抑制性差减杂交
甌江綵鯉%體色%差異錶達基因%抑製性差減雜交
구강채리%체색%차이표체기인%억제성차감잡교
为了解瓯江彩鲤红、白两种体色差异的分子基础,应用抑制性差减杂交(SSH)技术对这两种体色的差异表达基因进行了初步研究,以"全红"体色(全身体表为红色)彩鲤的cDNA为检验cDNA(Tester),以"粉玉"体色(全身体表为粉白色)彩鲤的cDNA为比对cDNA(Driver),进行抑制差减杂交.对筛选出的42个阳性克隆进行测序和序列比对,发现16条EST序列,其余26个克隆为空载体序列.在16条EST序列中,6条为鲤的线粒体DNA序列(鲤的线粒体:16S rRNA序列,COⅢ),5条为斑马鱼的相关基因序列(斑马鱼的骺蛋白聚糖、核心蛋白聚糖、光蛋白聚糖等相关基因;斑马鱼新型免疫型受体基因,Olfm1蛋白合成基因;斑马鱼原骨胶原蛋白mRNA),1条为鲫的mRNA序列,2条与无脊椎动物基因相类似(利氏曼原虫的22号基因组基因;蝇的抗菌缩氨酸前体mRNA基因),另2条为未知基因序列;比对结果发现4条序列可能与体色有关.为进一步筛选鲤体色调控相关的功能基因奠定了基础.
為瞭解甌江綵鯉紅、白兩種體色差異的分子基礎,應用抑製性差減雜交(SSH)技術對這兩種體色的差異錶達基因進行瞭初步研究,以"全紅"體色(全身體錶為紅色)綵鯉的cDNA為檢驗cDNA(Tester),以"粉玉"體色(全身體錶為粉白色)綵鯉的cDNA為比對cDNA(Driver),進行抑製差減雜交.對篩選齣的42箇暘性剋隆進行測序和序列比對,髮現16條EST序列,其餘26箇剋隆為空載體序列.在16條EST序列中,6條為鯉的線粒體DNA序列(鯉的線粒體:16S rRNA序列,COⅢ),5條為斑馬魚的相關基因序列(斑馬魚的骺蛋白聚糖、覈心蛋白聚糖、光蛋白聚糖等相關基因;斑馬魚新型免疫型受體基因,Olfm1蛋白閤成基因;斑馬魚原骨膠原蛋白mRNA),1條為鯽的mRNA序列,2條與無脊椎動物基因相類似(利氏曼原蟲的22號基因組基因;蠅的抗菌縮氨痠前體mRNA基因),另2條為未知基因序列;比對結果髮現4條序列可能與體色有關.為進一步篩選鯉體色調控相關的功能基因奠定瞭基礎.
위료해구강채리홍、백량충체색차이적분자기출,응용억제성차감잡교(SSH)기술대저량충체색적차이표체기인진행료초보연구,이"전홍"체색(전신체표위홍색)채리적cDNA위검험cDNA(Tester),이"분옥"체색(전신체표위분백색)채리적cDNA위비대cDNA(Driver),진행억제차감잡교.대사선출적42개양성극륭진행측서화서렬비대,발현16조EST서렬,기여26개극륭위공재체서렬.재16조EST서렬중,6조위리적선립체DNA서렬(리적선립체:16S rRNA서렬,COⅢ),5조위반마어적상관기인서렬(반마어적후단백취당、핵심단백취당、광단백취당등상관기인;반마어신형면역형수체기인,Olfm1단백합성기인;반마어원골효원단백mRNA),1조위즉적mRNA서렬,2조여무척추동물기인상유사(리씨만원충적22호기인조기인;승적항균축안산전체mRNA기인),령2조위미지기인서렬;비대결과발현4조서렬가능여체색유관.위진일보사선리체색조공상관적공능기인전정료기출.