CAJ | 학술논문

参考已发表的猪瘟病毒(CSFV)Shimen株、HCLV株、Paderborn株的核苷酸序列,设计并合成11对引物,应用RT-PCR技术,成功地分11个片段扩增了CSFV广西流行毒株GXWZ02的全基因组.将这11个基因片段克隆,并测定了其核苷酸序列.应用计算机生物软件Vector NTI将11个基因片段进行拼接,确认CSFV GXWZ02株全基因组序列的长度为12 296个核苷酸(GenBank收录号AY367767).将GXWZ02株与国内外已发表的Shimen、HCLV、39、Brescia、Eystrup、Glentorf、Alfort187、Paderborn、CS、ALD、GPE-、P97、LPC毒株进行全基因组核苷酸序列和推定的氨基酸序列比较,核苷酸同源性分别为85.4%、84.6%、88.7%、85.7%、85.7%、85.3%、85.6%、95.3%、85.7%、85.7%85.4%、83.4%、84.3%,推定的氨基酸同源性分别为92.6%、91.7%、94.2%、93.1%、92.9%、92.3%、93.0%、97.7%、92.6%、93.0%、92.6%、90.5%、90.6%.GXWZ02与Shimen、HCLV的全基因组序列及推定的氨基酸序列有明显差异,表明GXWZ02株在遗传性和抗原性上发生了较明显的变化.系统发育树分析,所比较的14株CSFV被分为2个群:GXWZ02、Paderborn和39这3个毒株被归为群1,其余的11个毒株被归为群Ⅱ,GXWZ02与Paderborn的亲缘关系最接近.将GXWZ02与Shimen、HCLV基因组中单个基因分别进行核苷酸及推定的氨基酸序列同源性比较,结果显示,基因Ems、E2、P7、NS2、NS5A的遗传变异程度大,而NS3、NS4A、NS4B的遗传性则相对保守.
삼고이발표적저온병독(CSFV)Shimen주、HCLV주、Paderborn주적핵감산서렬,설계병합성11대인물,응용RT-PCR기술,성공지분11개편단확증료CSFV엄서류행독주GXWZ02적전기인조.장저11개기인편단극륭,병측정료기핵감산서렬.응용계산궤생물연건Vector NTI장11개기인편단진행병접,학인CSFV GXWZ02주전기인조서렬적장도위12 296개핵감산(GenBank수록호AY367767).장GXWZ02주여국내외이발표적Shimen、HCLV、39、Brescia、Eystrup、Glentorf、Alfort187、Paderborn、CS、ALD、GPE-、P97、LPC독주진행전기인조핵감산서렬화추정적안기산서렬비교,핵감산동원성분별위85.4%、84.6%、88.7%、85.7%、85.7%、85.3%、85.6%、95.3%、85.7%、85.7%85.4%、83.4%、84.3%,추정적안기산동원성분별위92.6%、91.7%、94.2%、93.1%、92.9%、92.3%、93.0%、97.7%、92.6%、93.0%、92.6%、90.5%、90.6%.GXWZ02여Shimen、HCLV적전기인조서렬급추정적안기산서렬유명현차이,표명GXWZ02주재유전성화항원성상발생료교명현적변화.계통발육수분석,소비교적14주CSFV피분위2개군:GXWZ02、Paderborn화39저3개독주피귀위군1,기여적11개독주피귀위군Ⅱ,GXWZ02여Paderborn적친연관계최접근.장GXWZ02여Shimen、HCLV기인조중단개기인분별진행핵감산급추정적안기산서렬동원성비교,결과현시,기인Ems、E2、P7、NS2、NS5A적유전변이정도대,이NS3、NS4A、NS4B적유전성칙상대보수.