蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2009年
3期
528-532
,共5页
夏润玺%李玉萍%王欢%李喜升%刘彦群%秦利%姜德富%鲁成
夏潤璽%李玉萍%王歡%李喜升%劉彥群%秦利%薑德富%魯成
하윤새%리옥평%왕환%리희승%류언군%진리%강덕부%로성
柞蚕%cDNA文库%RNA转录5′末端转换%表达序列标签%延伸因子-1α(EF-1α)
柞蠶%cDNA文庫%RNA轉錄5′末耑轉換%錶達序列標籤%延伸因子-1α(EF-1α)
작잠%cDNA문고%RNA전록5′말단전환%표체서렬표첨%연신인자-1α(EF-1α)
采用RNA转录5′末端转换(SMART)技术构建了柞蚕(Antheraea pernyi)蛹的全长cDNA文库.所构建cDNA文库的容量为5×105个独立克隆,插入片段长800～2 500 bp,且90%的插入片段大于1 kb.随机挑取288个克隆进行表达序列标签(EST)测序,有效序列为250条,根据EST测序结果计算文库重组率达95%.经序列拼接得到175个unigenes,通过序列比对发现其中97个unigenes与GenBank中的已知基因高度同源,且有88条全长序列,基因的完整性比率达90%.在随机EST测序中获得了具有5′端和3′端非编码区的延伸因子-1α基因(GenBank登录号:FJ788508),该基因cDNA全长 1 743 bp,有一个 1 392 bp的开放阅读框,编码含463个氨基酸残基的蛋白,蛋白的理论分子质量为50.4 kD,等电点8.96.EST测序分析表明,柞蚕蛹cDNA文库符合构建基因文库的质量要求,该文库的构建将有助于柞蚕功能基因的克隆和研究.
採用RNA轉錄5′末耑轉換(SMART)技術構建瞭柞蠶(Antheraea pernyi)蛹的全長cDNA文庫.所構建cDNA文庫的容量為5×105箇獨立剋隆,插入片段長800～2 500 bp,且90%的插入片段大于1 kb.隨機挑取288箇剋隆進行錶達序列標籤(EST)測序,有效序列為250條,根據EST測序結果計算文庫重組率達95%.經序列拼接得到175箇unigenes,通過序列比對髮現其中97箇unigenes與GenBank中的已知基因高度同源,且有88條全長序列,基因的完整性比率達90%.在隨機EST測序中穫得瞭具有5′耑和3′耑非編碼區的延伸因子-1α基因(GenBank登錄號:FJ788508),該基因cDNA全長 1 743 bp,有一箇 1 392 bp的開放閱讀框,編碼含463箇氨基痠殘基的蛋白,蛋白的理論分子質量為50.4 kD,等電點8.96.EST測序分析錶明,柞蠶蛹cDNA文庫符閤構建基因文庫的質量要求,該文庫的構建將有助于柞蠶功能基因的剋隆和研究.
채용RNA전록5′말단전환(SMART)기술구건료작잠(Antheraea pernyi)용적전장cDNA문고.소구건cDNA문고적용량위5×105개독립극륭,삽입편단장800～2 500 bp,차90%적삽입편단대우1 kb.수궤도취288개극륭진행표체서렬표첨(EST)측서,유효서렬위250조,근거EST측서결과계산문고중조솔체95%.경서렬병접득도175개unigenes,통과서렬비대발현기중97개unigenes여GenBank중적이지기인고도동원,차유88조전장서렬,기인적완정성비솔체90%.재수궤EST측서중획득료구유5′단화3′단비편마구적연신인자-1α기인(GenBank등록호:FJ788508),해기인cDNA전장 1 743 bp,유일개 1 392 bp적개방열독광,편마함463개안기산잔기적단백,단백적이론분자질량위50.4 kD,등전점8.96.EST측서분석표명,작잠용cDNA문고부합구건기인문고적질량요구,해문고적구건장유조우작잠공능기인적극륭화연구.
